关于仲裁确定劳动关系时效超时后能否直接法院起诉的问题，结论是：一般情况下，不能直接向法院起诉，但存在例外情形。 以下是详细分析：
一、一般原则：仲裁前置
在劳动争议处理中，我国实行的是“仲裁前置”原则，即劳动争议发生后，当事人必须首先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，才可以向人民法院提起诉讼。这一原则体现在《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第五条中，该条规定：“发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。”
二、时效超时的一般后果
如果当事人未能在法定的仲裁时效期间内（通常为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算）向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，那么其仲裁申请可能会被仲裁委员会以超过时效为由不予受理。在这种情况下，如果当事人直接向法院起诉，法院通常会以未经仲裁前置程序为由不予受理。
三、例外情形：直接起诉的可能性
尽管存在仲裁前置的原则，但在某些特定情况下，当事人可能无需经过仲裁前置程序而直接向法院起诉。这些情形主要包括：
双方达成仲裁协议并明确排除仲裁前置：如果双方当事人在劳动合同或其他协议中明确约定了发生劳动争议时直接向法院起诉，而排除了仲裁前置程序，那么在这种情况下，当事人可以直接向法院起诉。但这种情况在实践中较为罕见，因为劳动争议仲裁前置是法定原则，双方很难通过约定来排除。
仲裁委员会不予受理且未说明理由或理由不成立：如果当事人向仲裁委员会申请仲裁，但仲裁委员会不予受理且未说明理由或理由不成立，当事人可以向法院提起诉讼。不过，这通常需要当事人先通过行政复议或行政诉讼等途径对仲裁委员会的不予受理决定进行挑战，并获得有利结果后，才能再向法院起诉劳动争议本身。
涉及特定类型的劳动争议：在某些特定类型的劳动争议中，如因支付拖欠劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金事项达成的调解协议，用人单位在协议约定期限内不履行的，劳动者可以持调解协议书依法向人民法院申请支付令，而无需先经过仲裁前置程序。但这并不属于直接起诉劳动争议本身，而是通过申请支付令的方式快速实现权益。
四、建议与注意事项
及时申请仲裁：为了避免超过仲裁时效，建议当事人在发生劳动争议后尽快向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
咨询专业律师：如果当事人对仲裁时效或仲裁前置程序有疑问，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。
保留证据：在劳动争议处理过程中，保留好相关证据（如劳动合同、工资单、工作证等）对于维护自身权益至关重要。
如果你有具体的劳动争议问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。