确认劳动关系的争议确实受到仲裁时效的限制，但存在多种特殊情形影响时效的计算，法院所说的“不确认劳动关系再去仲裁过时效”需结合具体情况分析。以下是对此问题的详细解析：
一、仲裁时效的基本规定
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这一规定同样适用于确认劳动关系的争议。
二、仲裁时效的适用情况
一般情况：
- 劳动者在确认劳动关系时，若认为自身权利受到侵害，应自知道或应当知道之日起一年内提出仲裁申请。若超过这一时效期间，仲裁机构可能不予受理或驳回申请。
特殊情况：
- 持续劳动关系：如果劳动关系一直持续，对于确认劳动关系的仲裁申请，一般不受仲裁时效的限制。因为在此情况下，劳动者的权利处于持续被侵害状态，时效期间无法确定一个明确的起算点。
- 拖欠劳动报酬：劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效期间的限制；但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
- 时效中断：若劳动者向用人单位主张权利、向有关部门请求救济或用人单位同意履行义务等，仲裁时效会中断，并从中断时起重新计算一年。例如，劳动者在时效期间内向用人单位提出书面确认劳动关系的请求，并得到用人单位的回复或处理，此时时效中断，重新计算一年。
- 时效中止：因不可抗力或有其他正当理由导致无法在时效期内申请仲裁的，时效中止；从中止原因消除之日起，继续计算时效。例如，劳动者因突发疾病无法在时效期间内提出仲裁申请，待病情好转后，时效期间继续计算。
未签订书面劳动合同的情形：
- 对于此类情况下的仲裁时效起算点，实践中可能存在差异。有的从劳动者主张权利之日起计算，有的则从劳动关系终止之日起计算。具体需依据地区司法实践和案件情况确定。但无论如何，劳动者都应尽快提出仲裁申请，以避免时效过期。
三、法院所说的“不确认劳动关系再去仲裁过时效”的可能含义
- 法院可能是在提醒劳动者，如果未能在劳动关系存续期间或终止后的一年内提出确认劳动关系的仲裁申请，可能会面临时效过期的问题。但这并不意味着所有情况下都会过时效，因为存在上述特殊情形可能影响时效的计算。
- 法院也可能是在建议劳动者在确认劳动关系前，先尝试通过其他途径（如协商、调解等）解决争议，以避免不必要的仲裁程序。但如果这些途径无法解决问题，劳动者仍应及时提出仲裁申请。
四、法律建议
- 密切关注时效规定：劳动者应充分了解并遵循仲裁时效规定，确保在法定期限内提出仲裁申请。
- 及时收集证据：在仲裁过程中，证据是证明自己主张的关键。劳动者应及时收集、保存与劳动关系相关的证据材料，如工资单、工作证、考勤记录等。
- 咨询专业律师：在处理劳动争议时，劳动者可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为梁伟森律师，我擅长处理婚姻家庭、离婚、遗产继承、公司事务、劳动纠纷等领域的问题，欢迎直接向我咨询。
综上所述，确认劳动关系的争议确实受到仲裁时效的限制，但存在多种特殊情形可能影响时效的计算。劳动者在处理相关事务时，应充分了解并遵循时效规定，以有效维护自身合法权益。