核心结论：工程结算书对方只签名不愿意盖章，可先与对方沟通协商，若协商不成，根据具体情况可采取保留证据、发送律师函、提起诉讼等措施来维护自身权益。以下是具体分析：

1. 沟通协商
   • 原因探究：首先尝试与对方友好沟通，了解其不愿意盖章的具体原因。有可能是对方内部流程繁琐、对结算金额有异议但未明确提出，或者是对盖章的效力存在误解等。例如，对方可能认为签名已经具有法律效力，盖章是多此一举；也可能是公司近期财务紧张，担心盖章后必须立即支付款项。
   • 解决方案：针对不同的原因，提出合理的解决方案。如果是内部流程问题，可以给予对方一定的时间来完成盖章手续；如果对结算金额有异议，可以一起重新核对工程量和计价标准，达成一致后再盖章；如果是对盖章效力有误解，可以向对方解释盖章在法律上的重要意义，增强其盖章的意愿。
2. 保留证据
   • 证据类型：在沟通协商的同时，要保留好对方签名的工程结算书原件，以及其他与工程结算相关的证据，如工程合同、施工过程中的签证单、验收报告、往来函件等。这些证据可以证明工程的实际施工情况、双方的权利义务关系以及结算的依据。
   • 证据效力：签名的工程结算书在一定程度上具有法律效力，但盖章可以进一步增强其证明力。根据《民法典》相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。所以，即使对方未盖章，只要结算书内容真实、合法，且双方已经实际履行了部分或全部结算内容，该结算书仍然可以作为证据使用。
3. 发送律师函
   • 函件内容：如果沟通协商无果，可以考虑委托律师向对方发送律师函。律师函中要明确指出对方只签名不愿意盖章的行为可能面临的法律后果，如可能被认定为对结算书的认可，需要按照结算书的金额履行付款义务；同时要求对方在规定的期限内完成盖章手续，否则将采取进一步的法律措施。
   • 函件作用：律师函具有一定的威慑力，可以让对方认识到问题的严重性，促使其积极解决问题。有些对方在收到律师函后，会重新审视自己的行为，主动与发函方协商解决盖章问题。
4. 提起诉讼
   • 诉讼条件：如果对方仍然拒绝盖章，且经过多次沟通协商和发送律师函后仍无果，可以考虑向法院提起诉讼。在起诉时，要将签名的工程结算书作为重要证据提交给法院，同时提供其他相关证据，以证明自己的主张。
   • 诉讼结果：法院会根据双方提供的证据和相关法律规定进行审理。如果法院认定工程结算书真实有效，即使对方未盖章，也会判决对方按照结算书的金额履行付款义务。如果对方对结算金额有异议，法院可能会委托专业的鉴定机构对工程进行鉴定，以确定最终的结算金额。