企业以不打卡为由清退签订无固定期限劳动合同的员工，这一行为是否合法需分情况讨论，关键在于企业能否证明员工存在严重违反规章制度的行为，且该制度已依法公示并告知员工。以下从不同角度为你详细分析：
一、企业清退行为的合法性分析
若企业规章制度明确规定“不打卡视为旷工，旷工达到一定天数可解除劳动合同”，且该制度已依法公示并告知员工：
- 在此情况下，如果员工确实存在不打卡的行为，且企业能够证明员工旷工天数达到了制度规定的解除劳动合同的标准，那么企业清退员工的行为可能是合法的。
- 但需要注意的是，企业需承担举证责任，证明员工存在不打卡的行为以及旷工的天数。如果企业无法提供充分的证据，那么其清退行为可能构成违法解除劳动合同。
若企业规章制度未明确规定“不打卡视为旷工”或未依法公示、告知员工：
- 在此情况下，企业以不打卡为由清退员工，很可能被认定为违法解除劳动合同。因为企业无法证明其清退行为有合法的依据。
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在解除劳动合同时，应当遵循合法、公平、诚实信用的原则，并事先将理由通知工会。如果企业未遵循这些原则，其清退行为可能面临法律风险。
二、员工的应对策略
收集证据：
- 如果员工认为企业的清退行为不合法，首先应当收集相关证据，如劳动合同、工资单、考勤记录（如果有的话）、企业规章制度等。
- 这些证据将有助于员工证明其与企业存在劳动关系，以及企业清退行为的违法性。
与企业协商：
- 在收集到足够证据后，员工可以尝试与企业进行协商，要求企业撤销清退决定或给予合理的经济补偿。
- 协商过程中，员工可以引用相关法律法规，如《劳动合同法》中关于解除劳动合同的规定，以增强自己的谈判地位。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求企业承担违法解除劳动合同的法律责任。
- 在申请劳动仲裁时，员工需要提交仲裁申请书、相关证据材料以及身份证明等文件。劳动仲裁机构将依法进行审理，并作出裁决。
三、可能的法律后果
如果企业被认定为违法解除劳动合同：
- 根据《劳动合同法》的规定，企业可能需要向员工支付赔偿金，赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍。
- 经济补偿的标准则根据员工在企业的工作年限和月工资来确定，具体为：每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
如果企业被认定为合法解除劳动合同：
- 在此情况下，企业无需向员工支付赔偿金或经济补偿。但企业仍需确保其解除劳动合同的行为符合法律法规的规定，并承担相应的举证责任。
最后建议：面对企业以不打卡为由清退的情况，员工应保持冷静，及时收集证据并寻求法律帮助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的解答。