员工辞退赔偿金是按照劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资来计算，这个平均工资指的是应发工资，而非实发工资。以下是对此问题的详细解答：

一、法律依据与规定

1. 《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
2. 《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条：劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。劳动者工作不满12个月的，按照实际工作的月数计算平均工资。

二、应发工资与实发工资的区别

1. 应发工资：指用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给本单位劳动者的劳动报酬，一般包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等。在计算辞退赔偿金时，应发工资是计算基数。
2. 实发工资：是劳动者实际到手的工资，即应发工资扣除个人缴纳的社保、公积金、个人所得税等费用后的金额。实发工资不能作为计算辞退赔偿金的基数。

三、特殊情况下的处理

1. 月工资高于当地职工月平均工资三倍的情况：如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付。同时，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

   • 计算公式：经济补偿金 = 当地上年度职工月平均工资 × 3 × 工作年限（最高不超过12年）

2. 工作不满十二个月的情况：如果劳动者在用人单位工作不满十二个月，那么按照其实际工作的月数来计算平均工资，并以此作为计算经济补偿金的基数。

   • 计算公式：经济补偿金 = 实际工作月数对应的应发工资总额 ÷ 实际工作月数 × 工作年限对应的补偿月数（如工作6个月，则补偿月数为0.5）

3. 月平均工资低于当地最低工资标准的情况：如果劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的月平均工资低于当地最低工资标准，那么在计算经济补偿时，应当按照当地最低工资标准计算。

   • 计算公式：经济补偿金 = 当地最低工资标准 × 工作年限对应的补偿月数

四、举例说明

假设员工小李在某公司工作了3年，每月应发工资为8000元（包括基本工资、奖金、津贴等），实发工资为6500元（扣除社保、公积金、个人所得税等费用后）。若公司决定辞退小李，且小李的月工资未高于当地职工月平均工资的三倍，那么小李应获得的经济补偿金计算如下：

• 经济补偿金 = 8000元（应发工资） × 3年 = 24000元

若小李的月工资高于当地职工月平均工资的三倍，假设当地上年度职工月平均工资为5000元，三倍则是15000元，而小李的月工资为18000元，则经济补偿金计算如下：

• 经济补偿金 = 15000元（当地职工月平均工资的三倍） × 3年（但最高不超过12年，此处未超） = 45000元

综上所述，员工辞退赔偿金是按照劳动合同解除或者终止前十二个月的应发平均工资来计算，同时需考虑特殊情况下的处理方式。如有更多疑问，可以直接向我咨询。