结论：针对您签了中介合同但实际与公司存在劳动关系，想要进行劳动仲裁的情况，您需要先明确劳动关系，收集相关证据，然后按照劳动仲裁的流程进行申请。以下是我为您详细分析的步骤和建议：
一、明确劳动关系
实际劳动关系认定：尽管您签订了中介合同，但如果您实际上是在为公司提供劳动，接受公司的管理，并由公司支付劳动报酬，那么您与公司之间很可能存在实际的劳动关系。这一点是后续进行劳动仲裁的基础。
中介合同性质：中介合同通常用于约定中介服务的内容和费用，如果合同中并未明确排除劳动关系的建立，或者合同内容与实际履行情况不符，那么该合同可能不能作为否定劳动关系的依据。
二、收集证据
工作证据：收集您在公司工作的证据，如工作证、工作服、工作记录、考勤记录、工资条等，这些证据能够证明您与公司之间存在实际的劳动关系。
沟通记录：保留与公司沟通的记录，如邮件、短信、微信聊天记录等，这些记录可能包含公司对您的工作安排、管理指令等，也是证明劳动关系的重要证据。
证人证言：如果有同事或其他人能够证明您在公司工作的情况，他们的证言也可以作为证据使用。
三、劳动仲裁流程
提交申请：向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。在申请中，您需要明确仲裁请求，如确认劳动关系、支付未签劳动合同的双倍工资、补缴社会保险等。
受理审查：仲裁委员会会对您的申请进行受理审查，如果符合受理条件，会出具受理通知书，并通知公司进行答辩。
开庭审理：仲裁委员会会安排开庭审理，您需要出庭陈述事实、提供证据，并进行辩论。公司也会进行答辩和提供证据。
裁决：仲裁委员会会根据双方提供的证据和陈述，作出裁决。如果裁决支持您的请求，公司需要履行裁决义务；如果公司不履行，您可以向法院申请强制执行。
四、注意事项
时效性：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从您知道或者应当知道权利被侵害之日起计算。因此，您需要尽快行动，以免错过时效。
专业咨询：劳动仲裁涉及复杂的法律程序和证据规则，如果您对流程不熟悉或者证据收集有困难，建议向我咨询，我可以为您提供专业的法律帮助。
保留证据原件：在提交证据时，尽量保留证据原件，以便在需要时进行核对和验证。
如果您在劳动仲裁过程中遇到任何问题或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和帮助。