签订劳务合同但发生劳动关系争议时，仲裁处理的核心在于确认双方是否存在事实劳动关系，并据此适用劳动法律法规进行裁决。以下是具体分析：

1. 劳务合同与劳动关系的区分
   劳务合同通常用于约定提供一次性或特定服务，双方地位平等，适用《民法典》合同编；而劳动关系中劳动者受用人单位管理，提供长期劳动，适用《劳动法》《劳动合同法》。若实际履行中符合劳动关系特征（如考勤管理、工资按月发放、接受工作指令等），即使签订劳务合同，仍可能被认定为事实劳动关系。

2. 仲裁处理流程

   • 申请仲裁：劳动者需向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交申请，明确诉求（如确认劳动关系、支付工资、经济补偿等）。
     
   • 举证责任：劳动者需提供证据证明存在事实劳动关系，如工资支付记录、工作证、考勤记录、同事证言等；用人单位若主张为劳务关系，需提供反证（如项目合作协议、费用结算凭证等）。
     
   • 裁决依据：仲裁委将根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号）等规定，综合判断双方是否符合劳动关系的实质要件。

3. 可能的结果

   • 确认劳动关系：若仲裁委认定存在事实劳动关系，用人单位需承担劳动法下的义务（如补缴社保、支付未签合同双倍工资等）。
     
   • 驳回申请：若证据不足或实际符合劳务关系特征，仲裁委可能驳回劳动者诉求，双方按民事合同关系处理。

4. 建议

   • 劳动者：保留工作证据，明确诉求后及时申请仲裁；若对结果不服，可在15日内向法院起诉。
     
   • 用人单位：规范合同签订，避免混淆劳务与劳动关系；若确需劳务合作，建议明确约定权利义务并留存履约证据。

提示：劳动关系认定需结合具体事实和证据，若涉及复杂情形（如退休返聘、关联企业用工等），建议进一步提供细节以便针对性分析。