结论前置：公司因员工玩手机扣绩效是否合理，需分情况讨论，主要取决于公司规章制度是否合法有效、是否明确规定玩手机属于扣绩效的情形，以及该规定是否经过民主程序制定并公示。
若公司规章制度合法有效且明确规定玩手机扣绩效：
- 合法性基础：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。并且，用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
- 具体情形：如果公司规章制度中明确规定了员工在工作时间内玩手机属于违反劳动纪律的行为，并且规定了相应的扣绩效措施，同时该规章制度已经经过了民主程序制定并公示，那么公司因员工玩手机扣绩效是合理的。
若公司规章制度未明确规定玩手机扣绩效，或规章制度不合法：
- 未明确规定：如果公司规章制度中没有明确规定员工玩手机属于扣绩效的情形，那么公司单方面因员工玩手机扣绩效可能缺乏依据，员工有权对此提出异议。
- 规章制度不合法：如果公司规章制度未经过民主程序制定，或者未公示、未告知劳动者，那么该规章制度对劳动者不产生法律效力。在此情况下，公司因员工玩手机扣绩效也是不合理的。
从实际操作角度考虑：
- 合理性评估：即使公司规章制度中明确规定了玩手机扣绩效，公司在实际操作时也应考虑扣绩效的合理性。例如，员工玩手机是否确实影响了工作效率或工作质量，扣绩效的幅度是否合理等。如果扣绩效的幅度过大或者与员工玩手机的行为不成比例，那么这种扣绩效的做法也可能被视为不合理。
- 员工权益保护：员工在面对公司不合理扣绩效时，有权向公司提出异议，并要求公司给出合理的解释和依据。如果公司无法给出合理的解释和依据，员工可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
建议：作为员工，在面对公司因玩手机扣绩效的情况时，应首先查看公司规章制度中是否有相关规定，并评估该规定的合法性和合理性。如果认为公司的做法不合理，可以与公司进行沟通协商，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁。作为公司，在制定规章制度时，应确保规章制度的合法性和合理性，并明确规定各种违规行为的处理措施，以避免不必要的劳动纠纷。
后续行动依据：如果员工认为公司扣绩效的行为侵犯了自己的合法权益，可以根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。在处理此类纠纷时，员工应保留好相关证据，如公司规章制度、扣绩效的通知、工资条等，以便在仲裁或诉讼中证明自己的主张。