一次性发放4个月工资导致工资总额超过5000元，这一做法本身并不直接涉及违法性判断，是否合理需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：
一、从工资支付方式的角度
合法性基础：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《工资支付暂行规定》，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。工资支付方式（如按月、按周、按日或一次性支付）可由用人单位与劳动者协商确定，只要不违反法律法规的强制性规定，即具有合法性。
一次性支付工资的合理性：
- 在某些情况下，如员工离职、项目结束或双方协商一致，用人单位可能选择一次性支付多个月工资。这种做法本身并不违法，但需确保支付金额准确无误，且符合双方约定。
二、从个人所得税的角度
个人所得税计算：
- 工资薪金所得适用超额累进税率，税率从3%至45%不等。一次性发放4个月工资，虽然总额可能超过5000元，但并不意味着需要缴纳更高的税。个人所得税的计算是基于年度综合所得，而非单次发放金额。然而，如果一次性发放导致当月工资显著高于其他月份，可能会影响当月个人所得税的预扣预缴。
税务筹划建议：
- 为避免不必要的税务负担，用人单位和劳动者可考虑在合同中约定工资支付方式，如分期支付或按项目进度支付，以平衡各月收入，降低税负。
三、从劳动关系的稳定性角度
对劳动者的影响：
- 一次性发放多个月工资可能对劳动者的生活安排和财务规划产生影响。例如，如果劳动者依赖每月固定工资来支付日常开支，一次性发放可能导致资金流动性问题。
对用人单位的影响：
- 从用人单位角度看，一次性支付工资可能涉及资金安排和成本控制问题。此外，如果劳动者在收到工资后立即离职，用人单位可能面临一定的经济风险。
四、具体建议
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，应明确工资支付方式、时间和金额，确保自身权益不受损害。
- 如对一次性支付工资有异议，可与用人单位协商调整支付方式或寻求法律援助。
对于用人单位：
- 在决定一次性支付工资前，应充分考虑劳动者的实际需求和财务状况，避免给劳动者带来不必要的困扰。
- 确保支付金额准确无误，并保留相关支付凭证，以备不时之需。
总结来说，一次性发放4个月工资导致工资总额超过5000元，这一做法本身并不违法，但需结合具体情况分析其合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。