核心结论：针对公司用重度残疾人身份证做流水导致残疾人补贴被取消的情况，可通过以下步骤进行补救：立即与公司沟通要求停止侵权行为并恢复补贴资格；收集证据向当地残联或民政部门申诉；必要时通过法律途径维权。以下从不同角度展开详细说明：
一、与公司协商解决（优先尝试）
明确要求停止侵权行为
直接联系公司负责人，指出其使用残疾人身份证做流水属于违法行为（可能涉及《残疾人保障法》第六十八条“骗取残疾人福利”或《刑法》第二百六十六条诈骗罪），要求立即停止使用您的身份证件，并配合恢复补贴资格。
法律依据：根据《残疾人就业条例》第二十七条，用人单位不得虚报安排残疾人就业人数，骗取税收优惠或补贴。
要求书面道歉与补偿
若公司承认错误，可要求其出具书面道歉信，并协助您向残联提交恢复补贴的申请材料（如公司出具的《情况说明》、您的身份证、残疾证等）。
二、向行政主管部门申诉（关键步骤）
向当地残联提交书面申诉
携带身份证、残疾证、公司使用您身份证做流水的证据（如银行流水记录、公司盖章的文件等），向残联说明情况，要求重新审核您的补贴资格。
操作建议：残联通常有专门的“补贴复核”流程，需填写《残疾人补贴申诉表》并提交证据，一般会在15-30个工作日内反馈结果。
向民政部门举报公司违法行为
若残联未及时处理，可向当地民政局（或社会救助科）举报公司骗取补贴的行为，民政部门会联合残联、公安等部门调查，若查实公司存在违规，您的补贴资格可能被恢复，且公司会受到行政处罚。
三、法律维权（必要时的终极手段）
起诉公司侵犯个人信息权
若公司未经您同意使用身份证做流水，可依据《民法典》第一千零三十四条“自然人的个人信息受法律保护”，以“侵犯公民个人信息罪”向法院起诉，要求公司停止侵害、赔偿损失（如补贴损失、精神损害抚慰金等）。
证据要求：需证明公司使用您身份证的具体行为（如银行流水记录、公司内部文件、证人证言等）。
报警追究公司刑事责任（情节严重时）
若公司通过您的身份证骗取的补贴金额较大（通常需达到5000元以上），可能构成《刑法》第二百六十六条诈骗罪，您可向公安机关报案，要求立案侦查。
注意：需提供公司骗取补贴的具体金额证据（如残联的补贴发放记录、公司账户流水等）。
四、预防措施（避免再次发生）
挂失并补办身份证
立即到派出所挂失原身份证，并补办新证，防止公司继续使用您的旧证进行违规操作。
定期查询个人征信与补贴记录
通过“中国残疾人就业创业网络服务平台”或当地残联官网，定期查询您的补贴发放情况，若发现异常及时处理。
温馨提示：整个过程中务必保留所有证据（如沟通记录、文件、照片等），这些是后续维权的关键。若您在操作中遇到困难，可直接向我咨询具体细节，我会根据您的情况提供更针对性的建议。