针对您提出的“未完成工程竣工验收备案是否可以申请结算”的问题，这确实是一个涉及法律法规、合同条款以及实际操作层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律法规层面的分析
《中华人民共和国民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》第七百九十九条，建设工程竣工后，发包人应及时进行验收，验收合格后方可交付使用并支付价款。但该条也隐含了特殊情况，如发包人擅自使用未经验收的工程，可能视为对工程质量的认可，从而涉及结算问题。
- 同时，《民法典》第五百七十七条规定了违约责任，若发包人拖延验收但承包人已完成合同主要工作且工程质量符合基本要求，承包人有权要求按合同约定进行结算。
《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定：
- 该解释第九条明确指出，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用的，以转移占有之日为竣工日期，承包人可主张按合同约定进行结算。
- 第十四条进一步规定，发包人擅自使用后不能再以一般质量问题拒付工程款，为承包人提供了结算的依据。
- 第二十四条则指出，即使合同无效且未验收，只要工程质量合格，也可以参照实际履行的合同关于工程价款的约定进行折价补偿。
《中华人民共和国建筑法》及相关司法解释：
- 这些法律和解释同样支持了上述观点，即发包人擅自使用未经验收的工程，视为工程已经验收合格，承包人可以请求参照合同约定支付工程价款。
二、合同条款与实际情况的结合
- 在实际操作中，除了法律法规外，合同条款的具体约定也至关重要。如果合同中明确规定了按照节点或进度付款，并且这些约定不违反法律法规，那么即使工程未全部完工或验收，到了约定的节点或进度，承包人也有权要求发包人按约定支付款项。
三、可以申请结算的具体情况
合同有明确约定：
- 如果建设工程施工合同中明确规定了工程未经验收时的结算条件和方式，双方应依约进行结算。例如，合同约定按工程进度支付，达到特定节点后，即使整体工程未验收，施工方也可要求发包方支付相应阶段的工程款。
发包方擅自使用工程：
- 若发包方在未经验收的情况下擅自使用工程，此行为视为对工程质量的认可，承包方可要求结算。
双方协商一致：
- 若双方当事人在工程未验收的情况下，通过协商达成一致意见决定结算，该结算有效。
四、不建议申请结算或可能无法结算的情况
工程质量存在严重问题：
- 若工程存在严重影响正常使用和安全的质量问题，在质量问题未解决前，发包方有权拒绝结算。
未完成合同约定的工程量：
- 若承包方未按合同约定完成全部工程量，发包方可根据合同约定拒绝结算。
五、综合建议
- 工程验收的重要性：工程竣工验收是确保工程质量、安全、环保等方面符合标准和要求的必要环节，也是工程交付使用和进行结算的重要依据。因此，在可能的情况下，应优先完成工程竣工验收备案。
- 合同条款的明确性：为避免后续纠纷，建议在签订合同时，双方应明确约定工程验收、结算的相关条款，包括验收标准、程序、时间以及结算的条件、方式和时间等。
- 特殊情况的处理：若工程确实存在特殊情况需要提前结算，应与发包人协商并达成书面协议，明确相关细节，以确保双方权益得到保障。
综上所述，未完成工程竣工验收备案是否可以申请结算，需根据具体情况判断，并应遵循相关法律法规和合同约定。在实际操作中，双方应充分沟通、协商，并明确各自的权利和义务，以确保工程的顺利进行和结算的合法性。