打了协议纠纷，是否还和仲裁有关系，这主要取决于协议中的争议解决条款以及纠纷的具体情况。以下从几个不同角度进行分析：

1. 协议中有仲裁条款：

   • 如果双方在签订的协议中明确约定了争议解决方式为仲裁，并且该仲裁条款符合法律规定的生效要件（如双方意思表示真实、仲裁事项属于仲裁范围、仲裁机构明确等），那么一旦发生协议纠纷，双方就应当按照协议中的仲裁条款，将纠纷提交至约定的仲裁机构进行仲裁。
   • 在这种情况下，打了协议纠纷就意味着需要启动仲裁程序，仲裁结果对双方具有法律约束力。如果一方不履行仲裁裁决，另一方可以向人民法院申请强制执行。

2. 协议中没有仲裁条款，但事后达成仲裁协议：

   • 如果双方在签订协议时没有约定仲裁条款，但在纠纷发生后，双方又达成了书面的仲裁协议，同意将纠纷提交仲裁解决，那么同样可以依据该仲裁协议启动仲裁程序。
   • 这种情况下，虽然最初没有仲裁条款，但事后达成的仲裁协议同样具有法律效力，双方应当遵守。

3. 协议中没有仲裁条款，且事后也未达成仲裁协议：

   • 如果双方在签订协议时没有约定仲裁条款，且在纠纷发生后也未能达成书面的仲裁协议，那么双方就不能通过仲裁方式解决纠纷。
   • 在这种情况下，如果双方无法通过协商、调解等方式解决纠纷，一方或者双方可以向人民法院提起诉讼，通过诉讼程序解决纠纷。

4. 仲裁协议或条款的效力问题：

   • 需要注意的是，仲裁协议或条款的效力是启动仲裁程序的前提。如果仲裁协议或条款存在无效情形（如一方以欺诈、胁迫的手段订立仲裁协议，或者仲裁事项超出法律规定的仲裁范围等），那么仲裁协议或条款就无效，双方就不能通过仲裁方式解决纠纷。
   • 在这种情况下，如果双方无法通过协商、调解等方式解决纠纷，同样可以向人民法院提起诉讼。

建议：

• 在签订协议时，双方应当明确约定争议解决方式，可以选择仲裁或者诉讼，并明确约定仲裁机构或者管辖法院。
• 如果发生协议纠纷，双方应当首先查看协议中的争议解决条款，确定是否可以通过仲裁方式解决纠纷。
• 如果双方对仲裁协议或条款的效力有争议，或者无法确定是否可以通过仲裁方式解决纠纷，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

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