签署了无纠纷协议后，在特定情况下仍然可以申请仲裁。是否能仲裁需根据具体情况判断，以下从多个角度进行分析：
可以仲裁的情况
存在法定可撤销事由：
- 如果一方在签署无纠纷协议时受到欺诈、胁迫，或者对相关事实存在重大误解，该协议可能是可撤销的。在此情况下，当事人可以向仲裁机构申请仲裁，请求撤销协议并解决实际存在的纠纷。
- 举例：如一方故意隐瞒重要经济往来事实，导致另一方误签无纠纷协议，受欺诈方发现后可申请仲裁。
有新的证据证明存在未涵盖的纠纷：
- 若签署无纠纷协议后出现新证据，证明存在之前未发现或未处理的纠纷，当事人可依据新证据申请仲裁。
- 举例：签署后发现的财务账目显示有未结清款项，可作为新证据申请仲裁。
协议内容不明确或存在歧义：
- 如无纠纷协议中具体范围、含义不明确，导致双方理解产生分歧，而实际上存在纠纷，当事人可通过仲裁确定协议的真实意思并解决纠纷。
- 举例：协议笼统表述“无纠纷”，但具体业务往来或财务事项未明确，双方理解不一，可申请仲裁。
涉及仲裁协议的特殊约定：
- 如双方之前的仲裁协议中明确约定，即使签署无纠纷协议，对于某些特定类型的纠纷或在特定条件下仍可申请仲裁，则当事人可依据仲裁协议申请仲裁。
- 举例：仲裁协议约定知识产权相关纠纷不受无纠纷协议限制，后续出现此类纠纷可申请仲裁。
不可以仲裁的情况
- 协议是双方真实意思表示且不存在法定无效或可撤销事由：
- 如无纠纷协议是双方在平等、自愿、充分了解相关事实的基础上作出的真实意思表示，且不存在欺诈、胁迫、重大误解等法定无效或可撤销事由，则该协议对双方具有法律约束力，一般不能再申请仲裁。
- 举例：双方详细对账协商后签署无纠纷协议，且无违法违规或违背真实意愿情况，此时再申请仲裁可能不被受理。
仲裁申请条件与替代解决方式
- 根据《中华人民共和国仲裁法》的规定，仲裁申请需满足有仲裁协议、有具体的仲裁请求和事实理由、属于仲裁委员会受理范围等条件。
- 在签署无纠纷协议的情况下，若不满足上述可仲裁情形，通常无法启动仲裁程序。
- 除仲裁外，双方还可通过协商、调解、诉讼等方式解决纠纷。选择哪种方式需根据具体情况和双方当事人意愿决定。例如，如果双方希望保持友好关系，协商或调解可能是更好的选择；如果纠纷复杂且涉及较大金额，诉讼可能更为合适。
总结与建议：
签署了无纠纷协议后能否进行仲裁，需根据具体情况判断。在实际操作中，应仔细审查相关事实和法律依据，以确保自身权益得到妥善维护。如果存在法定可撤销事由、有新的证据证明存在未涵盖的纠纷、协议内容不明确或存在歧义、涉及仲裁协议的特殊约定等情形，当事人仍可申请仲裁。反之，如果协议是双方真实意思表示且不存在法定无效或可撤销事由，则一般不能再申请仲裁。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。