针对您提出的“司机以挂靠协议为由申请工伤认定需要满足什么条件”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
在司机以挂靠协议为由申请工伤认定的情况下，通常不需要确认司机与被挂靠单位之间存在实际的劳动关系。这一特殊规定主要基于《最高人民法院关于审理工伤保险行政案件若干问题的规定》中的相关条款，旨在充分保护劳动者的合法权益。
具体来说，需要满足以下条件：
存在挂靠经营关系：
- 司机所驾驶的车辆需挂靠于某个具有运输经营资质的单位（被挂靠单位）。
- 挂靠方（通常是车辆的实际所有人或经营者）与被挂靠单位之间需签订挂靠协议，明确双方的权利和义务。
司机因工伤亡：
- 司机在从事与挂靠经营相关的活动中（如驾驶挂靠车辆进行运输）遭受事故伤害或死亡。
- 该事故伤害或死亡需与挂靠经营活动有直接的因果关系。
被挂靠单位承担工伤保险责任：
- 根据法律规定，在挂靠经营情形下，被挂靠单位需承担司机因工伤亡的工伤保险责任。
- 这意味着，即使司机与被挂靠单位之间不存在实际的劳动关系，被挂靠单位仍需按照工伤保险的相关规定对司机进行赔偿。
注意事项：
- 不得随意突破劳动关系：虽然挂靠经营情形下工伤认定不以存在劳动关系为前提，但这并不意味着可以随意突破劳动关系进行工伤认定。只有在法律法规明确规定的情形下（如挂靠经营），方可突破劳动关系认定工伤。
- 厘清各方关系：在申请工伤认定时，需厘清挂靠方、被挂靠方以及司机之间的法律关系和相关事实，确保申请材料的真实性和准确性。
- 追偿权：被挂靠单位在承担工伤保险责任后，有权向相关责任方（如挂靠方或造成事故的第三方）进行追偿。
实例说明：
以您提供的案例为例，宋某驾驶的重型罐式半挂货车挂靠登记在某物流公司，实际系张某所有，宋某受雇于张某。在发生交通事故后，宋某向人社部门申请工伤认定，并最终被认定为工伤。尽管宋某与某物流公司之间不存在实际的劳动关系，但根据法律规定，某物流公司仍需承担工伤保险责任。
综上所述，司机以挂靠协议为由申请工伤认定时，主要需满足存在挂靠经营关系、司机因工伤亡以及被挂靠单位承担工伤保险责任等条件。希望这些解答能对您有所帮助。