在建设工程施工合同中，索要工程款纠纷与债权人代为诉讼一般不能直接一并起诉，但存在特定情形下可合并处理的情况。以下从不同角度为您详细分析：

一、一般情况下的分析

在建设工程施工合同纠纷中，索要工程款纠纷通常涉及的是承包人与发包人之间的债权债务关系，即承包人依据合同约定，要求发包人支付已完成工程部分的款项。而债权人代为诉讼，则是指当债务人怠于行使其对第三人的到期债权，对债权人造成损害时，债权人为保全自己的债权，可以以自己的名义代位行使债务人对第三人的权利。

1. 主体不同：索要工程款纠纷的主体是承包人与发包人，而债权人代为诉讼的主体则是债权人（通常是承包人）与债务人的债务人（可能是分包人、材料供应商等）。
2. 法律关系不同：索要工程款纠纷是基于建设工程施工合同产生的债权债务关系，而债权人代为诉讼则是基于债权的保全制度，涉及的是两个独立的法律关系。
3. 诉讼目的不同：索要工程款纠纷的目的是要求发包人支付工程款，而债权人代为诉讼的目的是通过代位行使债务人的权利，实现自己的债权。

由于上述差异，在一般情况下，索要工程款纠纷与债权人代为诉讼不能直接一并起诉。它们需要分别立案、分别审理，以维护各自法律关系的独立性和清晰性。

二、特定情形下的合并处理

尽管在一般情况下不能一并起诉，但在某些特定情形下，如当债权人（承包人）对债务人（如分包人）的债权与债务人对第三人的债权存在关联，且这种关联性对案件的审理和判决有重要影响时，法院可能会考虑将两个诉讼合并处理。然而，这种情况较为罕见，且需要满足严格的法律条件。

三、法律建议

1. 明确诉讼目的和主体：在提起诉讼前，应明确自己的诉讼目的和涉及的主体，确保诉讼的针对性和有效性。
2. 分别立案、分别审理：在一般情况下，应分别就索要工程款纠纷和债权人代为诉讼向法院提起诉讼，并分别准备相关证据和材料。
3. 咨询专业律师：由于建设工程施工合同纠纷和债权人代为诉讼都涉及复杂的法律关系和法律规定，建议在提起诉讼前咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。

总结来说，虽然索要工程款纠纷与债权人代为诉讼在一般情况下不能直接一并起诉，但在特定情形下可能存在合并处理的可能性。为了确保诉讼的顺利进行和自身权益的有效维护，建议您在提起诉讼前咨询专业律师，并根据具体情况制定合适的诉讼策略。如果您有任何关于建设工程施工合同或债权人代为诉讼的法律问题，欢迎直接向我咨询。