当公司被起诉，而涉及员工社保处理的问题时，这通常与社保费用的缴纳、扣除及返还等环节紧密相关。以下是对这一问题的详细解答：

一、社保费用的缴纳原则

根据《社会保险法》的相关规定，用人单位和职工应当依法共同缴纳基本养老保险、基本医疗保险和失业保险等社会保险费用。其中，职工应当缴纳的部分，通常由用人单位代扣代缴。这是社保制度的基本原则，确保了社保费用的及时、足额缴纳。

二、公司被起诉时社保费用的处理

1. 劳动关系存续期间：

   • 如果公司在劳动关系存续期间已经代缴了员工个人应当承担的社会保险费用，且这部分费用未从员工工资中扣除，那么在计算欠付工资时，应当将这部分社保个人承担部分予以扣除。这是基于《工资支付暂行规定》中关于用人单位可以代扣劳动者工资以缴纳社会保险费用的规定。

2. 劳动关系解除后：

   • 如果公司在劳动关系解除后仍为员工缴纳了社会保险费用，这部分费用发生于劳动关系解除后，并非履行劳动合同引发，因此不属于劳动争议受理范围。公司应当向社会保险费征收机构申请办理退费。如果社会保险费征收机构不予办理退费，公司可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。

三、具体案例分析

以您提供的案例为例：

• 案例一：甲公司与吕某的劳动争议中，甲公司在劳动关系存续期间代缴了吕某个人应当承担的社会保险费用，且未从吕某工资中扣除。法院在判决时，将这部分费用从甲公司欠付吕某的工资中予以扣除。同时，对于吕某离职后甲公司仍为其缴纳的社会保险费用，法院认为这不属于劳动争议受理范围，应通过相关行政管理部门处理。

• 案例二：叶婉静与公司的劳动争议中，公司要求叶婉静返还其在职期间公司代缴的个人应承担的社会保险费用。一审法院认为公司系自愿为叶婉静缴纳，未支持公司的诉求。但二审法院认为，虽然法律不禁止用人单位为员工支付个人应缴部分，但也没有规定用人单位支付后不能向员工追索。因此，二审法院支持了公司的诉求，要求叶婉静返还公司代缴的个人部分社保费用。

四、建议与总结

1. 公司层面：

   • 在劳动关系存续期间，应严格按照法律规定代扣代缴员工个人应当承担的社会保险费用，避免后续纠纷。
   • 在劳动关系解除后，应及时停止为员工缴纳社会保险费用，并办理相关退费手续。

2. 员工层面：

   • 应了解自己的社保缴纳情况，确保公司按时、足额为自己缴纳社会保险费用。
   • 如果公司存在未缴纳或未足额缴纳社会保险费用的情况，可以向劳动争议仲裁机构或法院提起诉讼或申请仲裁。

3. 总结：

   • 公司被起诉时涉及员工社保费用的处理，应遵循法律规定和合同约定。
   • 在劳动关系存续期间和解除后，公司应分别按照不同原则处理社保费用问题。
   • 双方应通过合法途径解决争议，维护自身合法权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告知。