当您的公积金被员工起诉后，处理这一问题需要遵循一定的法律程序和规定，以确保公正、合法地解决纠纷。以下是一些详细的步骤和建议，帮助您应对这种情况：

一、了解起诉原因及法律依据

首先，您需要明确员工起诉的具体原因，即单位是否未依法办理住房公积金缴存登记、未为其设立住房公积金个人账户，或者存在欠缴住房公积金的情况。根据《住房公积金管理条例》的相关规定，单位有义务按时、足额缴存住房公积金，不得逾期缴存或者少缴。

二、积极响应并参与调解

1. 接受调解：在收到员工起诉后，您可以主动与住房公积金管理中心联系，表达愿意通过调解方式解决纠纷的意愿。根据《青岛市住房公积金纠纷调解办法》等类似规定，调解是解决住房公积金欠缴纠纷的主渠道，且不收取任何费用。

2. 配合调解工作：在调解过程中，您需要积极配合调解组织的工作，提供必要的证据材料，如劳动合同、工资单等，以证明单位的缴存情况。同时，您也可以与员工协商补缴方案，争取达成双方都能接受的调解协议。

三、依法履行补缴义务

1. 确定补缴金额和期间：如果调解成功，您需要与员工确认补缴的金额和期间，并确保这些信息得到员工的签字确认。补缴金额应根据员工的实际工资收入和缴存比例来计算。

2. 及时补缴：在达成调解协议后，您应尽快按照协议要求完成住房公积金的补缴工作。这不仅可以避免进一步的法律纠纷，还能维护单位的良好形象。

四、应对行政执法和诉讼程序

1. 准备应对行政执法：如果调解未能成功，或者员工明确要求终止调解，住房公积金管理中心可能会启动行政执法程序。此时，您需要准备相关证据材料，以应对可能的行政处罚。

2. 参与诉讼程序：如果案件进入诉讼阶段，您应积极参与诉讼活动，包括提交答辩状、参加庭审等。在诉讼过程中，您应尊重法院的判决结果，并依法履行相应的义务。

五、加强内部管理和合规意识

为了避免类似的纠纷再次发生，您应加强单位内部的住房公积金管理，确保按时、足额缴存住房公积金。同时，提高员工的合规意识，让他们了解住房公积金的重要性和相关法规政策。

六、寻求专业法律帮助

在处理这类纠纷时，如果您感到困惑或无法独立应对，可以寻求专业律师的法律帮助。律师可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助您更好地维护单位的合法权益。

总之，当公积金被员工起诉后，您应积极响应并参与调解工作，依法履行补缴义务，并加强内部管理和合规意识。如果需要，可以寻求专业法律帮助以更好地应对纠纷。