公司通过别的公司账户发工资，这一行为本身并不直接违法，但可能存在一些潜在的法律风险和合规问题，需要具体分析。以下从不同角度为你详细分析：
一、合法性角度
工资支付主体：
- 通常情况下，工资应当由用人单位直接支付给劳动者。这是基于劳动合同的相对性原则，即用人单位与劳动者之间建立劳动关系，用人单位有义务直接向劳动者支付工资。
- 如果公司通过别的公司账户发工资，但能够证明这种支付方式是出于合理的业务安排（如集团内部资金调配、委托支付等），并且劳动者对此知情且未提出异议，同时这种支付方式没有损害劳动者的合法权益（如未拖欠工资、未克扣工资等），那么这种支付方式在法律上可能被视为合法。
税务合规性：
- 从税务角度来看，公司通过别的公司账户发工资可能涉及税务申报和缴纳的问题。如果这种支付方式导致税务申报不实或逃避税务监管，那么就可能构成违法行为。
- 因此，公司在采用这种支付方式时，需要确保税务申报的准确性和合规性，避免因此引发税务风险。
二、潜在风险角度
劳动者权益保护：
- 如果公司通过别的公司账户发工资，且劳动者对此不知情或提出异议，那么这种支付方式可能损害劳动者的合法权益。例如，劳动者可能无法及时收到工资、工资被克扣或拖欠等。
- 在这种情况下，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
公司合规风险：
- 公司通过别的公司账户发工资可能违反公司的内部财务管理制度或相关法律法规的规定。例如，如果这种支付方式未经公司董事会或股东会的批准，或者违反了相关金融监管规定，那么公司可能面临合规风险。
- 此外，如果这种支付方式被用于非法目的（如洗钱、逃税等），那么公司还可能面临更严重的法律后果。
三、建议与措施
对于公司：
- 如果公司确实需要通过别的公司账户发工资，应当确保这种支付方式的合法性和合规性。具体来说，公司应当与劳动者签订书面协议，明确支付方式、支付时间、支付金额等关键条款，并确保劳动者对此知情且同意。
- 同时，公司应当加强内部财务管理和税务申报工作，确保这种支付方式不会引发税务风险或合规问题。
对于劳动者：
- 如果劳动者发现公司通过别的公司账户发工资，且对此存在疑虑或不满，应当及时与公司沟通并了解具体情况。如果公司无法给出合理的解释或解决方案，劳动者可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁以维护自己的合法权益。
总结来说，公司通过别的公司账户发工资并不直接违法，但需要确保这种支付方式的合法性和合规性，并充分考虑劳动者的权益保护。如果有任何疑问或担忧，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。