建筑施工三方协议在符合法律法规规定的情况下是合法的。以下从多个角度对建筑施工三方协议的合法性进行详细分析：

一、协议主体合法性

建筑施工三方协议通常涉及建设单位（甲方）、总包单位（乙方）和分包单位（丙方）三方主体。根据《建筑法》及相关法律法规的规定，这些主体需具备相应的民事权利能力和民事行为能力，能够独立承担民事责任。具体来说：

1. 建设单位：作为工程项目的发起者和总投资方，需具备合法的项目立项和审批手续，确保项目的合法性和合规性。
2. 总包单位：需持有合法有效的建筑施工企业资质证书，并在其资质等级许可的范围内承揽工程。
3. 分包单位：同样需具备相应的专业承包资质，且分包范围需符合法律法规的规定，不得将工程分包给不具备相应资质条件的单位。

二、协议内容合法性

建筑施工三方协议的内容需符合国家法律法规、产业政策和投资管理规定，不得包含违法违规条款。具体来说，协议应明确以下关键内容：

1. 工程概况：包括工程名称、地点、规模、承包方式等基本信息，确保工程内容的合法性和明确性。
2. 分包范围与方式：详细列明丙方负责的具体工程部分及分包方式，如包工包料、专业分包等，确保分包行为的合法性和合规性。
3. 工程价款与支付方式：约定丙方完成工程的价款及其支付方式和期限，确保价款支付的合法性和合理性。
4. 工程质量与进度：规定丙方应达到的工程质量标准和施工进度要求，以及监督和验收机制，确保工程质量和进度的可控性。
5. 安全生产：明确各方在安全生产方面的责任和义务，确保施工安全，符合《安全生产法》等相关法律法规的规定。
6. 违约责任：规定各方违约时应承担的责任和赔偿方式，确保协议的约束力和可执行性。

三、签订程序合法性

建筑施工三方协议的签订程序也需符合法律法规的规定。具体来说：

1. 招投标程序：对于依法必须进行招标的项目，应按照《招标投标法》的规定进行招标，确保招投标程序的合法性和公正性。若应招标而未招标或招投标程序违法，所签协议可能被认定无效。
2. 意思表示真实性：协议需体现双方真实意思表示，不存在欺诈、胁迫、重大误解、显失公平等情形。若存在这些情形，受损害方可请求变更或撤销协议。

四、其他考虑因素

除了上述因素外，建筑施工三方协议的合法性还可能受到以下因素的影响：

1. 公序良俗原则：协议内容或目的若违反社会公共利益、公共秩序和善良风俗，将被认定为无效。
2. 法律法规的更新：随着法律法规的不断更新和完善，建筑施工三方协议的内容也需相应调整，以确保其合法性和有效性。

五、法律建议

为确保建筑施工三方协议的合法性和有效性，建议各方在签订协议前仔细审查各项条款，确认双方主体资格，并遵循相关法律法规及程序要求。如有必要，可咨询专业律师进行法律审核，以确保协议的合法性和有效性。在协议履行过程中，各方也应严格遵守协议约定，及时沟通解决问题，避免影响工程进度和质量。

综上所述，建筑施工三方协议在符合法律法规规定的情况下是合法的。若您在建筑施工三方协议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。