员工超时加班所获得的收入，在特定情况下确实可能被视为违法收入。以下是对这一问题的详细分析：
一、超时加班的违法性
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。如果用人单位违反这一规定，强制或变相强制劳动者超时加班，就构成了违法行为。
二、违法收入的定义与认定
违法收入通常指的是因违法行为而获得的收入。在超时加班的情境下，如果用人单位未按照法律规定支付加班费，或者支付的加班费低于法定标准，那么劳动者因超时加班而获得的这部分收入（即未足额支付的加班费部分），在法律上可能被视为因用人单位的违法行为而产生的“不当得利”或“违法所得”（此处从劳动者角度可理解为因单位违法未足额支付而应得未得的补偿性收入，从单位角度可视为其违法成本的一部分，严格意义上说劳动者本身获得的是应得报酬，但单位未支付部分构成违法，若单位已支付但不足额，不足部分可视为单位违法应补足的部分；若从单位支付超出法定标准加班费是否违法及收入性质角度，通常单位支付不足才涉及违法，支付超标一般不直接定性为违法收入，但此处核心讨论的是超时加班下未依法支付报酬的情形）。不过，更准确的表述是，用人单位因超时加班而未依法支付给劳动者的加班费，属于用人单位的违法成本，用人单位有义务补足这部分费用，并可能面临劳动行政部门的处罚。而对于劳动者而言，其应得的加班费是其劳动的合法报酬，并非违法收入，但若劳动者因单位违法未获得足额报酬，其有权要求单位补足。
三、超时加班的法律后果
对用人单位的处罚：根据《劳动保障监察条例》的规定，用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章延长劳动者工作时间的，由劳动保障行政部门给予警告，责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。
对劳动者的补偿：如果用人单位未按照法律规定支付加班费，劳动者有权要求用人单位补足加班费，并可能根据具体情况要求用人单位支付经济补偿金或赔偿金。
四、实际案例与操作建议
在实际操作中，如果劳动者发现用人单位存在超时加班且未依法支付加班费的情况，可以采取以下措施：
与用人单位协商：首先尝试与用人单位协商，要求其补足加班费并调整加班制度。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，要求其对用人单位的违法行为进行查处。
申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动监察部门的处理结果不满意，劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
总结来说，员工超时加班本身并不直接导致其获得的收入成为违法收入，但用人单位因超时加班而未依法支付给劳动者的加班费，属于用人单位的违法成本，用人单位有义务补足。劳动者有权要求用人单位依法支付加班费，并在必要时通过法律途径维护自己的权益。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。