针对您提出的“年终奖以工资的形式发放怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确年终奖与工资在性质、功能及税务处理上的显著差异。工资是劳动者因提供劳动而获得的常规性报酬，具有稳定性，它基于劳动合同的约定及正常劳动义务产生。而年终奖则是用人单位根据经营状况、员工绩效等综合因素自主决定的额外奖励，它并非法定必须支付的劳动报酬，但如果劳动合同或公司规章制度中有明确约定，年终奖则具备合同属性。

当公司选择将年终奖以工资的形式发放时，可能会带来一系列问题：

1. 税务与福利影响：工资与年终奖的税务处理方式是不同的，混淆发放可能导致员工的税负增加。同时，年终奖的发放还可能影响员工的社保、公积金等其他福利待遇的计算与缴纳。

2. 权益影响：将年终奖当作工资发放，可能会影响经济补偿金、加班工资基数等以工资为计算依据的项目，导致员工在离职或解除劳动合同时应得的经济补偿金数额出现偏差。此外，年终奖作为对一年工作的肯定，其突然变成工资可能引发员工的不公平感，进而影响工作积极性和团队氛围。

针对这一问题，我为您提供以下应对建议：

1. 查看合同与制度：

   • 您应仔细查阅劳动合同及公司规章制度，明确其中关于年终奖与工资的具体约定和规定。
   • 若合同或制度中有明确区分，公司混淆发放的行为可能构成违约，您有权要求公司按照正确方式发放年终奖。

2. 与公司沟通：

   • 发现混淆发放情况后，您应首先与公司人力资源部门或上级领导进行友好沟通，要求公司按照正确方式发放年终奖并纠正错误处理。
   • 沟通时建议采用书面形式，如电子邮件，以便留存证据，为后续可能的法律途径提供支持。

3. 寻求法律帮助：

   • 若与公司沟通无果，您可以向劳动监察部门投诉，由其对公司的行为进行调查和纠正。
   • 您也可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司按照约定或规定发放年终奖，并赔偿因错误发放导致的损失。在仲裁过程中，您需提供充分证据支持自己的主张。

4. 提前了解薪酬福利调整：

   • 作为员工，您有权了解公司的薪酬福利政策及其调整情况。如果公司计划调整薪酬福利，应提前与您沟通并确保合法合规，避免后续产生矛盾。

综上所述，年终奖与工资在性质、功能及税务处理上均有显著差异，公司不应将其混为一谈。您应密切关注自身合同与公司制度，确保权益不受损害，并在发现问题时积极采取措施维护自身合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。