结论：在此情况下，被告是否应支付对价，主要取决于原告修建三层楼房的行为性质、双方之间的约定以及相关法律规定。以下从不同角度进行分析：
一、原告修建行为性质及双方约定
无偿修建：
- 若原告修建三层楼房的行为是无偿的，即原告出于某种原因（如亲情、友情等）自愿为被告修建，且双方没有约定被告需要支付对价，那么被告在接受并使用该楼房后，通常无需支付对价。
- 法律依据：此情况下，主要依据双方之间的约定（或无约定时的自愿行为原则）来判断，法律并未强制要求被告支付对价。
有偿修建：
- 若原告修建三层楼房的行为是有偿的，即双方约定了被告需要支付一定的对价作为修建费用，那么被告在接受并使用该楼房后，应当按照约定支付对价。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议，受法律保护。双方之间的约定具有法律约束力，被告应当履行支付对价的义务。
二、相关法律规定及法律后果
不当得利：
- 若原告修建三层楼房的行为原本并非出于无偿，且被告在接受并使用该楼房后未支付对价，而原告又因此遭受了损失，那么被告的行为可能构成不当得利。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条的规定，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。在此情况下，原告有权要求被告支付相应的对价或返还楼房（若楼房可分割或返还且不影响被告基本生活）。
合同纠纷：
- 若双方之间存在关于修建楼房的合同关系，且合同中明确约定了被告需要支付对价，但被告未履行支付义务，那么原告可以依据合同法的相关规定，要求被告承担违约责任。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》合同编的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
三、实际操作建议
协商解决：
- 在双方争议不大且愿意沟通的情况下，建议首先通过协商的方式解决纠纷。双方可以就支付对价的具体金额、支付方式等事项进行协商，并达成书面协议以避免后续纠纷。
法律途径：
- 若协商无果或双方争议较大，原告可以考虑通过法律途径解决纠纷。原告可以向法院提起诉讼，要求被告支付对价或承担其他相应的法律责任。在诉讼过程中，原告需要提供充分的证据证明自己的主张，如修建楼房的合同、支付费用的凭证等。
进一步思考：在实际操作中，还需要考虑楼房的产权归属、修建过程中的资金来源、双方之间的经济关系等多种因素。因此，在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。若您有相关法律问题，可以直接向我咨询。