核心前提：原告未取得合法土地使用手续，被告房屋涉及该土地，需明确双方权利义务及纠纷处理方式。

结论与处理建议：

1. 确认土地权属与合法性
   被告需首先核实土地权属及原告主张的合法性。若原告未取得土地使用权证、规划许可等合法手续，其主张可能缺乏法律依据。被告可要求原告提供土地权属证明（如土地使用权证、出让合同等），若原告无法提供，被告可主张其占用土地行为违法，房屋权属不受影响。

2. 行政程序优先：申请权属确认或查处违法占地
   若原告无合法手续却实际占用土地，被告可向自然资源部门（原国土部门）申请：

   • 土地权属争议调查处理：要求确认土地使用权归属；
     
   • 查处违法占地行为：若原告占用土地未获审批，被告可举报其违法占地，由行政部门责令退还土地或拆除地上建筑物。
     法律依据：《土地管理法》第14条（权属争议处理）、第77条（违法占地处罚）。

3. 民事诉讼：主张排除妨害或确认合同无效

   • 若原告主张房屋权利：被告可反诉原告侵权，要求其停止侵害、排除妨害（如拆除违法建筑、返还土地）；
     
   • 若双方存在合同关系（如买卖、租赁）：因原告无合法手续，合同可能因违反法律强制性规定（如《民法典》第153条）被认定无效，被告可主张返还财产或赔偿损失。
     示例：若原告将无合法手续的土地及房屋卖给被告，被告可起诉要求确认合同无效、返还购房款。

4. 刑事风险防范：避免“以刑促民”陷阱
   若原告以“诈骗”“非法占用农用地”等罪名报案，被告需核实自身行为是否涉及刑事犯罪（如是否明知土地违法仍购买、是否破坏农用地）。若无犯罪故意，可向公安机关说明情况，避免被错误追责。

关键提醒：

• 被告需保留土地权属证明、规划许可、购房合同等证据，证明自身合法性；
  
• 避免自行拆除房屋或与原告发生冲突，优先通过行政或司法程序解决；
  
• 若土地性质为集体所有（如宅基地），需注意非集体成员不得取得使用权，合同可能无效。

后续建议：
如需进一步分析具体证据或制定诉讼策略，可直接向我提供土地性质、权属证明、合同文本等材料，我将结合《土地管理法》《民法典》等规定，为您设计维权方案。