核心结论：公司停业补偿员工时，若员工工作时间有中断，补偿计算需根据中断原因及具体情况，结合法律法规来确定，常见情况如下：

1. 因公司原因导致的工作中断

   • 补偿计算基础：若工作时间中断是由于公司经营困难、停业整顿等公司方面的原因，且中断期间员工未提供劳动并非员工过错导致，在计算经济补偿时，通常应将中断前后的工作时间合并计算。例如，员工在公司工作了5年，中间因公司原因停业1年，之后公司正式停业与员工解除劳动关系，那么计算经济补偿的工作年限一般按6年计算。
   • 法律依据：根据《劳动合同法》第四十七条规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“工作年限”在符合上述情况时应合并计算。

2. 因员工个人原因导致的工作中断

   • 补偿计算基础：如果工作时间中断是员工个人原因，如员工主动离职后又重新入职、员工因个人原因请假长时间未上班等，那么在计算经济补偿时，中断前的工作年限一般不计入。例如，员工在公司工作了3年，之后因个人原因离职1年，然后又重新入职公司工作2年，公司停业与员工解除劳动关系时，计算经济补偿的工作年限通常按2年计算。
   • 特殊情况：不过，如果员工离职后再次入职，且前后两段工作经历符合一定条件，有些地方性法规或政策可能会有特殊规定允许合并计算工作年限，但这并非普遍情况，需要结合当地的具体规定来判断。

3. 中断期间公司仍支付工资或缴纳社保等情况

   • 补偿计算基础：若工作时间中断期间，公司仍然按照规定为员工支付工资、缴纳社会保险等，这种情况下一般也倾向于将中断前后的工作时间合并计算经济补偿的工作年限。因为从实质上看，员工与公司之间的劳动关系在这期间并未完全实质性解除，公司仍在履行一定的用人单位义务。
   • 举证责任：员工需要提供相关证据证明中断期间公司与自己仍存在劳动关系以及公司履行了相应义务，如工资支付记录、社保缴纳记录等。

建议：在实际操作中，公司停业补偿涉及的具体情况可能更为复杂，如果员工和公司对于工作时间中断后的补偿计算存在争议，建议先与公司进行友好协商，尽量达成一致的补偿方案。如果协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。如果你还有其他关于公司停业补偿或劳动法律方面的问题，欢迎直接向我咨询。