结论前置：出具解除劳动关系证明书后，若双方存在劳动争议且该争议属于《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》规定的受理范围，劳动者或用人单位可以单独就争议事项申请劳动仲裁。以下从不同角度详细分析：

一、可单独申请仲裁的法定情形

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，以下劳动争议即使已出具解除劳动关系证明书，仍可单独申请仲裁：

1. 确认劳动关系争议
   若双方对劳动关系存续期间（如入职时间、离职时间）或是否存在事实劳动关系存在分歧，例如劳动者主张实际入职时间早于合同记载，而用人单位不认可，此时可申请仲裁确认劳动关系。

2. 解除劳动合同合法性争议

   • 用人单位可能存在违法解除行为（如无故解除、未支付经济补偿），或解除协议中未约定工作交接、工资结算等条款的履行方式，劳动者可就解除合法性或条款履行争议申请仲裁。
     
   • 示例：用人单位以“劳动者不能胜任工作”为由解除合同，但未提供培训或调岗记录，劳动者可主张违法解除并要求赔偿。

3. 除名、辞退、辞职、离职争议
   若劳动者认为解除劳动关系证明是在欺诈、胁迫或非自愿情况下签订的（如用人单位威胁“不签字就不发工资”），可申请仲裁撤销解除行为并恢复劳动关系。

4. 劳动报酬、经济补偿争议

   • 用人单位未支付解除合同的经济补偿金、拖欠工资、未支付加班费或工伤医疗费等，劳动者可就具体金额争议申请仲裁。
     
   • 示例：解除合同时用人单位承诺支付“N+1”补偿但事后拒付，劳动者可追讨差额。

5. 社会保险、福利、劳动保护争议
   即使劳动关系已解除，若劳动者发现用人单位在其工作期间存在未依法缴纳社保、未提供劳动保护等情形，仍可申请仲裁要求补缴或赔偿。

二、仲裁时效与证据准备

1. 仲裁时效

   • 一般情况下，劳动争议申请仲裁的时效期间为1年，自当事人知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
     
   • 例外：劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，不受1年时效限制；但劳动关系终止后，应自终止之日起1年内提出。

2. 证据准备
   申请仲裁时需提交以下材料以证明主张：

   • 劳动合同、解除劳动关系证明书；
     
   • 工资单、考勤记录、工作记录；
     
   • 通讯记录（如微信、邮件）证明用人单位存在违法解除或未履行义务；
     
   • 其他能证明权益受损的证据（如工伤认定书、医疗费单据）。

三、实务建议

1. 及时主张权利：若发现用人单位存在违法解除或未履行义务的情形，应在时效期内申请仲裁，避免因超期丧失胜诉权。
   
2. 完整保留证据：解除劳动关系前，建议劳动者通过书面形式（如邮件、短信）与用人单位确认解除原因、补偿金额等关键条款，并留存证据。
   
3. 分情形主张诉求：若争议涉及多项诉求（如违法解除赔偿金+未支付加班费），可一并列入仲裁请求，避免多次仲裁增加维权成本。

总结：出具解除劳动关系证明书后，若双方存在劳动争议且符合法定情形，劳动者或用人单位均可单独申请仲裁。建议根据争议类型准备证据，并在时效期内主张权利。如有具体纠纷，可直接向我咨询，我将结合案情提供详细法律分析。