如果员工签订了协议但老板不认可，首先需要明确的是协议的性质以及老板不认可的具体原因，再据此采取不同的应对措施。以下是从不同角度给出的详细分析和建议：
一、协议性质与效力
协议是否合法有效：
- 协议内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害国家、集体、第三人的利益。
- 协议双方必须具备相应的民事行为能力，且意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 如果协议符合上述条件，那么它就是合法有效的，老板不认可并不能改变其法律效力。
协议是否已实际履行：
- 如果协议已经实际履行，且履行过程中没有出现违约或争议，那么老板的不认可可能只是口头上的，不影响协议的效力。
- 如果协议尚未履行或履行过程中出现争议，老板的不认可可能构成对协议履行的拒绝，此时需要进一步分析原因并采取措施。
二、老板不认可的原因及应对措施
老板对协议内容有误解或不清楚：
- 建议：与老板进行沟通，解释协议的具体内容和条款，消除误解或澄清不清楚的地方。
- 行动：可以准备一份协议的摘要或重点条款说明，以便更直观地展示协议内容。
老板认为协议条款不公平或不合理：
- 建议：首先尝试与老板协商修改协议条款，以达成双方都能接受的共识。
- 行动：如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决争议，如申请劳动仲裁或提起诉讼。在此过程中，需要收集并保留好相关证据，如协议文本、沟通记录等。
老板故意违约或拒绝履行协议：
- 建议：如果老板故意违约或拒绝履行协议，且协商无果，那么员工可以依法维护自己的权益。
- 行动：
- 收集证据：包括协议文本、履行协议的证据（如工作记录、工资单等）、与老板的沟通记录等。
- 申请劳动仲裁：如果协议涉及劳动争议，可以向当地劳动仲裁委员会申请仲裁。
- 提起诉讼：如果仲裁结果不满意或协议不涉及劳动争议，可以向人民法院提起诉讼。
三、法律背景与依据
- 《中华人民共和国劳动合同法》：该法规定了劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止等事项，为处理劳动争议提供了法律依据。
- 《中华人民共和国民法典》：该法规定了民事法律行为的一般规定，包括协议的效力、履行、违约责任等，为处理非劳动争议的协议纠纷提供了法律依据。
四、可能面临的法律后果
- 如果老板不认可合法有效的协议并拒绝履行，可能构成违约行为，需要承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
- 如果员工通过法律途径维护自己的权益并胜诉，老板可能需要履行协议或支付相应的赔偿。
综上所述，面对老板不认可已签订协议的情况，员工应首先明确协议的性质和效力，然后分析老板不认可的原因并采取相应的应对措施。如果协商无果，可以依法维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。