针对您提出的“土地租赁合同超20年部分确认合同无效后，投资人建设的房屋如何赔偿”的问题，以下是我根据相关法律法规及实践经验，为您提供的详细解答：
一、合同无效的基本处理原则
首先，根据《中华人民共和国民法典》的规定，土地租赁合同的租赁期限不得超过二十年。超过二十年的部分，将被视为无效。但这并不影响合同中其他未超过二十年部分的效力。在处理无效部分时，我们需遵循法律法规，确保双方权益得到合理保护。
二、房屋赔偿的具体分析
房屋建设情况与合同效力的关系：
- 投资者在租赁土地上建设的房屋，其赔偿问题需结合房屋的建设情况、合同的具体条款以及双方的过错程度来综合判断。
若房屋建设在合同有效期内：
- 如果房屋是在合同有效的二十年内建设的，且建设行为符合合同约定和法律法规，那么投资者对房屋享有合法的权益。在合同无效后，投资者有权要求出租人按照房屋的实际价值或双方协商的价格进行赔偿。
若房屋建设跨越了合同有效与无效部分：
- 如果房屋的建设跨越了合同的有效期和无效期，那么需要区分不同时间段的建设成本和价值。对于有效期内建设的部分，投资者有权要求赔偿；对于无效期内建设的部分，则可能需要根据双方的过错程度来分担损失。
出租人的过错与赔偿责任：
- 如果合同超过20年部分无效是由出租人的过错导致（如明知租赁期限限制却故意签订长期合同），那么出租人应承担投资者因此遭受的全部损失，包括房屋的建设成本、预期收益等。
双方都有过错的情况：
- 如果双方均知晓租赁期限规定但仍签订超过20年的合同，那么双方应根据各自的过错程度来分担损失。例如，投资者可能因过于信赖出租人而承担部分损失，出租人则因违反法律规定而承担另一部分损失。
三、赔偿的具体操作与建议
协商赔偿：
- 在合同无效后，双方应首先尝试通过协商来达成赔偿协议。这可以节省时间和成本，并维护双方的商业关系。
评估房屋价值：
- 如果协商不成，投资者可以委托专业的评估机构对房屋的价值进行评估，以作为赔偿的依据。
法律途径解决争议：
- 如果双方无法就赔偿问题达成一致，投资者可以通过诉讼或仲裁等法律途径来维护自己的权益。在此过程中，建议投资者咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保护。
四、预防措施与建议
为了避免类似情况的发生，投资者在签订土地租赁合同时应：
- 仔细审查合同条款，确保租赁期限不超过二十年；
- 了解并遵守相关法律法规，避免违法行为；
- 在合同中明确约定房屋建设、赔偿等条款，以减少未来可能出现的争议。
综上所述，土地租赁合同超20年部分确认合同无效后，投资者建设的房屋的赔偿问题需结合具体情况来综合判断。在处理过程中，建议投资者保持冷静、理性，通过协商或法律途径来维护自己的权益。