结论前置：运输公司被挂靠车辆的司机与公司之间，在一般情况下不被直接认定为存在劳动关系，而是更倾向于被认定为劳务关系或其他民事法律关系。但在特定情境下，如司机实际接受挂靠公司的管理并从事其安排的工作，双方可能形成事实劳动关系。
一、一般情况下的法律关系分析
挂靠关系的本质：
- 挂靠关系是指个人（挂靠人）出资购买车辆，但为了满足运营要求，将车辆登记在具有运输经营权资质的单位（被挂靠公司）名下，以该单位的名义进行运营。
- 在这种关系中，挂靠人自主经营、自负盈亏，被挂靠公司通常不参与车辆的日常运营和管理。
司机与被挂靠公司的关系：
- 司机通常由挂靠人（实际车主）雇佣，工资由挂靠人支付，工作安排和日常管理也由挂靠人负责。
- 被挂靠公司与司机之间不存在直接的招聘、录用、考勤、考核等劳动关系中的核心要素。
- 因此，在一般情况下，司机与被挂靠公司之间不被认定为存在劳动关系。
二、特定情境下的劳动关系认定
事实劳动关系的形成：
- 如果司机实际接受被挂靠公司的管理，从事被挂靠公司安排的工作，并获取相对稳定的劳动报酬，那么双方可能形成事实劳动关系。
- 这种情况下，法院会综合考虑多种因素，如司机是否接受被挂靠公司的日常管理和工作安排、是否从被挂靠公司获取相对稳定的劳动报酬等。
司法实践中的认定：
- 根据相关法律规定和司法实践，个人挂靠其他单位对外经营时，其聘用的人员因工伤亡的，被挂靠单位为承担工伤保险责任的单位。但这并不等同于认定双方存在劳动关系。
- 在多数情况下，法院会倾向于认定司机与实际车主之间存在雇佣关系或劳务关系，而与被挂靠公司之间不存在劳动关系。然而，在特定情境下，如上述所述，法院也可能认定双方存在事实劳动关系。
三、法律建议与风险提示
对于司机而言：
- 在接受挂靠车辆的工作时，应明确与挂靠人（实际车主）之间的雇佣关系或劳务关系，并签订相关协议以明确双方的权利和义务。
- 如果希望与被挂靠公司建立劳动关系，应要求被挂靠公司直接进行招聘、录用、考勤、考核等管理，并签订劳动合同。
对于被挂靠公司而言：
- 在允许个人挂靠车辆进行运营时，应明确与挂靠人之间的权利和义务，并签订挂靠合同以规范双方的行为。
- 如果对挂靠人聘用的司机进行了一定程度的管理和指挥，应谨慎评估是否可能形成事实劳动关系，并采取相应的风险防范措施。
风险提示：
- 在未明确劳动关系的情况下，如果司机在工作中发生伤亡事故，可能会引发劳动争议和工伤赔偿纠纷。
- 因此，建议各方在签订相关协议时，应明确约定各自的权利和义务，以避免潜在的法律风险。
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