司机挂靠公司，在车辆运营中伤亡的，可以认定为工伤。具体分析如下：

司机挂靠公司的情况，通常指个人购买的车辆挂靠在其他单位名下，并以该单位的名义对外运营。在这种情况下，虽然司机是由车辆实际所有人聘用，并未与挂靠公司签订劳动合同，但挂靠公司收取挂靠费，实质上也是受益人。因此，司机与挂靠公司之间形成了间接的雇佣关系，也即事实上的劳动关系。

根据最高人民法院行政审判庭的答复（〔2006〕行他字第17号），个人购买的车辆挂靠其他单位且以挂靠单位的名义对外经营的，其聘用的司机与挂靠单位之间形成了事实劳动关系。在车辆运营中伤亡的，应当适用《劳动法》和《工伤保险条例》的有关规定认定是否构成工伤。

也就是说，如果司机在挂靠公司名下运营车辆时发生伤亡事故，且没有《工伤保险条例》规定的蓄意违章、自杀或自残等排除认定工伤的情形，那么就应该依法认定为工伤。司机或其家属可以依法向挂靠公司主张工伤赔偿。

综上所述，司机挂靠公司算工伤，但具体认定还需根据实际情况和相关法律法规进行具体分析。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。