超时加班责令整改后不整改属于违法行为，将面临行政处罚，情节严重还可能涉及刑事责任。以下从不同角度为你详细分析：

从行政责任角度

1. 法律依据 根据《劳动保障监察条例》第三十条规定，用人单位有下列行为之一的，由劳动保障行政部门责令改正；对有第（一）项、第（二）项或者第（三）项规定的行为的，处2000元以上2万元以下的罚款：
   • 无理抗拒、阻挠劳动保障行政部门依照本条例的规定实施劳动保障监察的；
   • 不按照劳动保障行政部门的要求报送书面材料，隐瞒事实真相，出具伪证或者隐匿、毁灭证据的；
   • 经劳动保障行政部门责令改正拒不改正，或者拒不履行劳动保障行政部门的行政处理决定的；
   • 打击报复举报人、投诉人的；
   • 法律、法规规定的其他情形。

如果用人单位被责令整改超时加班问题后拒不整改，就符合上述第（三）项情形，劳动保障行政部门有权对其处以2000元以上2万元以下的罚款。

1. 处理流程 劳动保障行政部门在发现用人单位存在超时加班且责令整改不整改的情况后，会先进行调查取证，确认违法事实。然后会向用人单位下达行政处罚决定书，明确处罚的种类和幅度。用人单位在收到处罚决定书后，应在规定的期限内缴纳罚款，如果对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。

从刑事责任角度（情节严重情况）

1. 法律依据 如果用人单位强迫劳动者超时加班，情节恶劣，构成犯罪的，依据《中华人民共和国刑法》第二百四十四条之一规定，以强迫劳动罪追究直接负责的主管人员和其他直接责任人员的刑事责任。强迫劳动罪是指以暴力、威胁或者限制人身自由的方法强迫他人劳动的，或者明知他人以暴力、威胁或者限制人身自由的方法强迫他人劳动，而为其招募、运送人员或者以其他方式协助强迫他人劳动的行为。
2. 情节严重的认定 例如，用人单位长期强迫劳动者每天工作超过12小时，甚至达到16小时以上，且劳动者多次提出异议，用人单位仍不改正；或者因超时加班导致劳动者出现严重健康问题，如过劳死、重大疾病等，这些情况都可能被认定为情节恶劣，相关责任人员将面临刑事处罚。

从劳动者权益保护角度

1. 劳动者可以采取的措施 如果劳动者发现用人单位存在超时加班且责令整改后仍不整改的情况，可以向当地劳动保障监察部门投诉举报，提供相关证据，如考勤记录、工资条、工作安排通知等，以协助劳动保障行政部门进行调查处理。同时，劳动者也可以依法解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条规定，用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：
   • 未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；
   • 未及时足额支付劳动报酬的；
   • 未依法为劳动者缴纳社会保险费的；
   • 用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；
   • 因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的；
   • 法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。 用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动者劳动的，或者用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全的，劳动者可以立即解除劳动合同，不需事先告知用人单位。
2. 经济补偿标准 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条规定，劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

如果你在超时加班整改相关问题上还有疑问，或者遇到其他法律问题，都可以直接向我咨询。