当员工需要在家加班并希望与公司协商加班工资时，可以按照以下步骤进行：
一、了解公司政策和法律法规
查阅公司政策：首先，员工应仔细查阅公司的员工手册或相关规章制度，了解公司对于加班工资的具体规定。这包括加班工资的计算方法、支付标准以及申请流程等。
了解法律法规：同时，员工也应了解国家及地方关于加班工资的相关法律法规，确保自己的权益得到保障。例如，劳动法规定了加班工资的计算方法和支付标准，员工应确保公司遵守这些规定。
二、与公司进行沟通
提出加班申请：在加班前，员工应提前向公司提出加班申请，并明确加班的时间、工作内容以及预期完成的目标。这有助于公司了解员工的加班需求，并合理安排工作。
协商加班工资：在提出加班申请的同时，员工可以与公司相关负责人（如人力资源部门或直接上级）协商加班工资的事宜。员工可以基于公司政策和法律法规，提出自己的合理诉求，并寻求双方都能接受的解决方案。
保留证据：在沟通过程中，员工应保留好相关的沟通记录，如邮件、聊天记录等，以备后续需要时作为证据使用。
三、寻求第三方协助
内部调解：如果员工与公司之间在加班工资问题上存在分歧，可以先尝试通过内部调解的方式解决。员工可以寻求公司内部的调解机构或相关部门的帮助，以达成双方都能接受的协议。
劳动仲裁：如果内部调解无法解决问题，员工可以向当地的劳动仲裁机构申请仲裁。在申请仲裁前，员工应准备好相关的证据材料，如加班记录、沟通记录、公司政策等，以支持自己的诉求。
法律诉讼：如果劳动仲裁仍然无法解决问题，员工可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。在这种情况下，员工应咨询专业的律师，了解相关的法律程序和诉讼要求。
四、注意事项
合理诉求：在协商加班工资时，员工应提出合理的诉求，并基于公司政策和法律法规进行协商。过高的要求可能导致协商失败，甚至影响员工与公司的关系。
及时沟通：员工应及时与公司进行沟通，明确加班工资的事宜。避免因为沟通不畅或拖延而导致问题悬而未决。
保持冷静：在协商过程中，员工应保持冷静和理智，避免情绪化的言辞或行为。这有助于双方更好地沟通并达成共识。
总之，员工在协商在家加班的加班工资时，应了解公司政策和法律法规、与公司进行沟通、寻求第三方协助并注意相关事项。通过合理的诉求和有效的沟通，员工有望与公司达成双方都能接受的协议。