针对您提出的问题“公司更换主体员工拒签，原主体已注销怎么办”，以下是我的详细解答：
公司主体更换与员工合同关系
- 当公司主体发生更换（如公司合并、分立、股权转让等导致公司实体变更），原公司与员工的劳动合同关系原则上应由新主体承继。这是基于《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更、解除、终止等均需遵循法定程序，且公司主体的变更并不直接导致劳动合同的无效或解除。
- 若员工拒绝与新主体签订劳动合同，这并不改变原劳动合同的效力及新主体应承担的义务。但员工的行为可能构成对新工作安排的拒绝，新主体有权根据内部规章制度或劳动合同约定进行处理。
原主体已注销的法律后果
- 若原主体已注销，其法律人格已消灭，无法再作为劳动合同的一方主体。此时，若新主体未与员工签订新的劳动合同，但员工仍在为新主体提供劳动，则双方之间可能形成事实劳动关系。
- 事实劳动关系下，员工仍享有劳动法规定的各项权益，如获得劳动报酬、享受社会保险等。新主体作为实际用工单位，应承担相应的法律责任。
员工拒签新合同的处理建议
- 沟通协商：新主体应首先与员工进行沟通，了解其拒签的原因，并尝试通过协商解决分歧。例如，可以解释公司主体变更的背景、新合同的条款内容等，以消除员工的顾虑。
- 书面通知：若沟通无果，新主体可以向员工发出书面通知，要求其在一定期限内签订新合同。通知中应明确说明不签订合同的法律后果，如可能导致的劳动关系解除、经济补偿等。
- 解除劳动关系：若员工在规定期限内仍未签订新合同，且新主体认为继续维持劳动关系已无必要或可能，新主体可以依据《劳动合同法》的相关规定，与员工解除劳动关系。但需注意，解除劳动关系应遵循法定程序，如提前通知、支付经济补偿等。
特殊情况下的处理
- 员工主张原合同继续有效：若员工主张原劳动合同继续有效，并要求新主体履行原合同义务，新主体可以依据《劳动合同法》的相关规定及公司主体变更的实际情况进行抗辩。但需注意，若原合同中有特别约定（如合同主体变更时的处理方式），则应优先遵循约定。
- 涉及经济补偿或赔偿：若因公司主体变更或员工拒签新合同导致劳动关系解除，且涉及经济补偿或赔偿问题，新主体应依据《劳动合同法》的相关规定及双方协商的结果进行处理。例如，根据员工在公司的工作年限、工资水平等因素计算经济补偿金额。
总结与建议：
- 公司主体更换时，应确保与员工的劳动合同关系得到妥善处理，避免因此产生法律纠纷。
- 若员工拒绝与新主体签订劳动合同，新主体应通过沟通协商、书面通知等方式尝试解决问题。
- 若问题无法解决且新主体认为继续维持劳动关系已无必要或可能，可以依据法定程序与员工解除劳动关系。
- 在处理过程中，新主体应严格遵守《劳动合同法》等相关法律法规的规定，确保自身行为的合法性。
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