公司主体变更，员工拒签后公司直接辞退员工，这种行为是违法的。下面我为您详细解释：

1. 合同变更需协商：

   • 根据法律规定，公司主体变更往往涉及劳动合同内容的变更。此时，用人单位应与劳动者协商一致，并采用书面形式变更劳动合同约定内容。

2. 拒签后的处理：

   • 如果员工拒签变更协议，公司不能直接以此为由辞退员工。因为这种行为属于违法解除劳动合同，公司或用人单位需承担相应的法律责任。

3. 员工的权利：

   • 员工在拒签变更协议后，有权要求公司继续履行原劳动合同。
   • 如果员工不要求继续履行或劳动合同已无法继续履行，公司需按员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准，向员工支付二倍的赔偿金。

4. 法律依据：

   • 这种规定是基于《劳动合同法》等相关法律法规，旨在保护劳动者的合法权益，防止用人单位随意变更劳动合同或辞退员工。

综上所述，公司主体变更时，员工拒签变更协议后，公司直接辞退员工是违法的。员工可以依法维护自己的权益，要求公司继续履行合同或支付赔偿金。如果您遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。