将一审法院判决将当事人另案的自认判决认定为本案的自认，这一行为主要涉及事实认定问题，但也可能间接关联程序合法性，具体取决于法院的认定过程和依据是否符合法定程序。以下从不同角度进行详细分析：
一、事实认定角度
自认的定义与效力：
- 自认是指当事人在诉讼过程中，就对方所主张的事实表示承认或同意。自认一旦作出，通常对当事人产生拘束力，法院在审理案件时，可以依据自认的事实进行裁判，无需再对该事实进行举证证明。
另案自认与本案的关系：
- 另案的自认，即当事人在其他案件中作出的自认，原则上仅对该案具有拘束力。若要将另案的自认适用于本案，需满足一定条件，如另案与本案存在关联性，且另案的自认事实与本案事实相同或相似。
- 如果一审法院未经充分审查，直接将另案的自认判决认定为本案的自认，可能忽视了另案与本案在事实、法律关系等方面的差异，导致事实认定错误。
事实认定的合法性：
- 法院在认定事实时，应依据证据规则和法定程序进行。如果一审法院在认定本案自认事实时，未遵循法定程序，如未给予当事人充分陈述、辩论的机会，或未对另案自认事实与本案事实的关联性进行充分审查，则可能构成事实认定违法。
二、程序合法性角度
程序公正原则：
- 程序公正要求法院在审理案件时，遵循法定程序，保障当事人的诉讼权利。如果一审法院在认定自认事实时，违反了法定程序，如未依法通知当事人参加庭审、未依法组织证据交换等，则可能构成程序违法。
程序违法的后果：
- 如果一审法院的程序违法行为影响了案件的公正审理，当事人可以依法提出上诉或申请再审。上级法院在审查时，将重点审查一审法院的程序是否合法，以及程序违法是否影响了案件的公正判决。
三、具体建议
审查一审判决：
- 当事人应仔细审查一审判决，分析法院在认定自认事实时的依据和程序是否合法。如果发现法院存在事实认定错误或程序违法的情况，可以依法提出上诉或申请再审。
收集证据：
- 当事人应积极收集与自认事实相关的证据，以证明一审法院在认定事实时存在错误或违法。这些证据可以包括另案的庭审记录、判决书、当事人的陈述等。
咨询专业律师：
- 鉴于法律问题的复杂性和专业性，建议当事人在处理此类问题时咨询专业律师。律师将根据当事人的具体情况和法律规定，提供针对性的法律建议和帮助。
总结来说，一审法院将当事人另案的自认判决认定为本案的自认，主要涉及事实认定问题，但也可能间接关联程序合法性。当事人在处理此类问题时，应仔细审查一审判决，收集相关证据，并咨询专业律师以获取针对性的法律建议。