结论：总包单位用微信通知要求分包单位停工，其合法性不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、通知形式与合同约定

1. 合同有明确约定：

   • 若双方签订的合同中明确规定了通知的形式，例如要求必须采用书面形式（如邮件、传真、信函等），则总包单位通过微信通知停工可能不符合合同约定，此时该通知可能不具备法律效力。
   • 法律依据：根据《民法典》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。若合同明确约定了通知形式，则应遵循该约定。

2. 合同无明确约定：

   • 若合同未明确规定通知的形式，则总包单位通过微信通知停工，在微信内容明确、具体且能够证明发送方和接收方身份的情况下，该通知可能被视为有效。
   • 实践操作：在实际操作中，微信等电子通讯方式因其便捷性而被广泛使用。然而，为了确保通知的有效性，建议总包单位在微信通知后，再通过其他书面形式进行确认，或要求分包单位进行书面回复确认。

二、通知内容的明确性与合理性

1. 通知内容明确：

   • 微信通知中应明确停工的原因、期限、范围等关键信息。若通知内容模糊不清，可能导致分包单位无法准确理解总包单位的意图，进而引发纠纷。
   • 法律后果：若因通知内容不明确导致分包单位遭受损失，总包单位可能需要承担相应的赔偿责任。

2. 通知内容合理：

   • 总包单位要求停工的原因应合理且合法，如因设计变更、施工条件变化等。若总包单位无正当理由要求停工，可能构成违约或侵权。
   • 法律后果：若总包单位无正当理由要求停工，分包单位有权要求总包单位继续履行合同或赔偿损失。

三、证据留存与法律效力

1. 证据留存：

   • 无论采用何种通知形式，总包单位都应妥善留存通知的证据，如微信聊天记录、邮件截图、书面通知等。这些证据在后续可能发生的纠纷中至关重要。
   • 建议：为了增强证据的证明力，总包单位可以在微信通知后，要求分包单位进行书面回复确认，或通过其他方式（如邮件、传真）进行再次通知。

2. 法律效力：

   • 微信通知的法律效力取决于其是否能够满足法律对证据的要求。在民事诉讼中，电子数据（如微信聊天记录）可以作为证据使用，但需满足真实性、关联性、合法性的要求。
   • 法律依据：根据《民事诉讼法》的相关规定，证据包括电子数据等。然而，电子数据作为证据使用时，需经过质证和认证程序，以确认其真实性和证明力。

四、实际操作建议

1. 优先采用书面形式：

   • 为了确保通知的有效性和避免纠纷，建议总包单位在要求分包单位停工时，优先采用书面形式（如邮件、传真、信函等）进行通知。

2. 微信通知作为补充：

   • 在紧急情况下或无法及时采用书面形式时，总包单位可以先通过微信等电子通讯方式进行通知，但应及时补发书面通知或要求分包单位进行书面回复确认。

3. 明确合同条款：

   • 在签订合同时，双方应明确约定通知的形式、内容、期限等关键条款，以减少后续可能发生的纠纷。

总结：总包单位用微信通知要求分包单位停工的合法性需结合具体情况判断。为了确保通知的有效性和避免纠纷，建议总包单位在通知时优先采用书面形式，并在微信通知后及时补发书面通知或要求分包单位进行书面回复确认。同时，双方在签订合同时应明确约定通知的相关条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。