针对您提出的“违法工作纪律是扣绩效还是扣工资”的问题，这并非一个非此即彼的简单选择，而是需要根据具体情况、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断的。以下是我从不同角度为您进行的分析：
公司规章制度的角度：
- 公司通常会制定一套完善的规章制度，其中会明确规定员工违反工作纪律时的处罚措施。这些措施可能包括扣绩效、扣工资、警告、记过、降职、解雇等。
- 因此，具体是扣绩效还是扣工资，首先需要查看您所在公司的规章制度。如果规章制度中明确规定了违反某项工作纪律将扣绩效，那么公司就应当按照规章制度执行；如果规定的是扣工资，则同样应按此执行。
法律法规的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司不得随意扣除员工的工资。工资是员工劳动的报酬，公司只有在法定情形下（如员工造成公司经济损失、违反公司规章制度且规章制度中有明确规定等）才能扣除工资，且扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
- 对于绩效的扣除，虽然法律法规没有直接规定，但绩效通常与员工的工作表现、工作成果等挂钩。如果公司规章制度中明确规定了绩效的考核标准和扣除条件，且这些标准和条件不违反法律法规的强制性规定，那么公司是可以根据规章制度扣除员工绩效的。
实际操作的角度：
- 在实际操作中，公司可能会根据违规的严重程度、员工的过往表现、公司政策等因素来综合决定是扣绩效还是扣工资。例如，对于轻微的违规行为，公司可能选择扣绩效以作为警告；对于严重的违规行为，公司则可能选择扣工资甚至解雇员工。
- 无论公司选择哪种处罚方式，都必须确保处罚的合法性和合理性。如果公司随意扣除员工工资或绩效，且没有合理的依据和程序，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
建议：
- 如果您发现自己因违反工作纪律而被扣绩效或工资，首先应当查看公司的规章制度，了解处罚的依据和程序。
- 如果您认为公司的处罚不合理或违法，可以与公司进行沟通协商，要求公司提供合理的解释和证据。
- 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
最后，每个公司的情况和规章制度都有所不同，因此在实际操作中可能会存在差异。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。