关于罚款绩效工资1000是否合法的问题，这主要取决于用人单位的规章制度、扣款原因及扣款方式是否符合法律法规。以下是对此问题的详细分析：

1. 规章制度明确且合理的情况

   • 如果用人单位有明确合法的规章制度，规定了罚款事项及标准，并且该规章制度已经过民主程序制定，内容不违反法律法规的强制性规定，已向员工公示或告知，那么罚款绩效工资1000可能是合法的。但罚款金额必须合理，通常每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地最低工资标准。若1000元的罚款超过了这一限额，或者规章制度本身存在问题，则这种罚款行为可能是违法的。

2. 员工造成经济损失的情况

   • 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿可以从劳动者本人的工资中扣除，但同样需遵循扣除限额和最低工资标准。如果1000元的罚款是基于员工造成的经济损失，并且符合上述条件，那么这种罚款可能是合法的。

3. 绩效不达标的情况

   • 绩效工资作为浮动工资，公司可以通过绩效考核来增减员工的绩效工资。若员工绩效不达标，公司根据绩效考核结果扣减工资是合法的，前提是绩效考核制度合法且公正。然而，如果公司没有明确的绩效考核制度，或者制度本身存在问题，那么随意扣减绩效工资1000元可能是违法的。

4. 不合法的情况

   • 如果公司没有合法有效的规章制度作为依据，或规章制度本身违法（如违反法律法规、显失公平等），则随意对员工进行罚款扣工资是违法的。此外，即使公司有规章制度，但罚款理由不充分、不合理（如因轻微过失而进行过重罚款），这种罚款扣工资行为也可能被认定为不合法。

员工权益保护建议：

• 面对不合法的罚款扣工资行为，员工首先可以尝试与公司沟通，要求解释罚款扣工资的理由和依据，寻求双方都能接受的解决方案。
• 若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并处理。
• 在必要时，员工还可以向当地劳动仲裁机构申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。

总结：罚款绩效工资1000是否合法，需要综合考虑多个因素，包括用人单位的规章制度、扣款原因及扣款方式等。如果用人单位的行为符合法律法规的规定，并且罚款金额合理，那么这种罚款可能是合法的。否则，员工有权采取措施维护自己的合法权益。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。