公司拍摄员工上厕所照片的行为通常构成违法，主要侵犯了员工的隐私权。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》第一千零三十二条：自然人享有隐私权。任何组织或者个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。隐私是自然人的私人生活安宁和不愿为他人知晓的私密空间、私密活动、私密信息。厕所作为员工进行个人生理活动的场所，显然属于私密空间，员工在厕所内的活动也属于私密活动。
《中华人民共和国民法典》第一千零三十三条：除法律另有规定或者权利人明确同意外，任何组织或者个人不得实施下列行为，其中就包括拍摄、窥视他人的私密活动。公司未经员工同意，擅自拍摄员工上厕所的照片，显然违反了这一规定。
二、行为分析
侵犯隐私权：如前所述，厕所是员工的私密空间，员工在厕所内的活动属于私密活动。公司未经允许拍摄员工上厕所的照片，直接侵犯了员工的隐私权。
可能涉及其他违法行为：如果公司将拍摄的照片用于非法目的，如传播、侮辱或威胁员工，还可能构成其他违法行为，如名誉权侵权、肖像权侵权等。这些行为不仅违反了民法典的相关规定，还可能触犯刑法，面临更严重的法律后果。
三、公司可能的辩解与反驳
公司管理需要：有些公司可能会以管理需要为由进行辩解，认为拍摄员工上厕所的照片是为了监督员工行为或防止员工在厕所内进行不当活动。然而，管理需要并不能成为侵犯员工隐私权的正当理由。公司应当通过合法、合理的方式进行管理，如设置监控摄像头在公共区域（但需明确告知员工并遵守相关法律法规），而不是采取侵犯员工隐私权的手段。
员工同意：如果公司在拍摄前未获得员工的明确同意，那么其拍摄行为就是违法的。即使员工事后表示同意，也不能改变拍摄行为当时的违法性。因为隐私权是员工的固有权利，未经其同意不得被侵犯。
四、建议与措施
员工应维护自身权益：如果员工发现公司存在此类侵权行为，应及时与公司沟通并要求其停止侵权行为。如果沟通无果，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。在维护自身权益的过程中，员工可以保留相关证据，如照片、视频、聊天记录等，以便在需要时提供证明。
公司应遵守法律法规：公司应严格遵守相关法律法规，尊重员工的隐私权和其他合法权益。在管理过程中，应采取合法、合理的方式，避免侵犯员工的隐私权。如果公司确实需要设置监控摄像头等设备，应明确告知员工并遵守相关法律法规的规定。
作为刘超律师，我建议你如果遇到类似情况，首先要保持冷静，不要与公司发生直接冲突。然后，及时收集证据并寻求法律援助，以维护自己的合法权益。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。