工厂安排休息并扣除加班费是否合法，需分情况讨论：

1. 正常休息日或法定节假日安排休息

   • 若工厂安排的休息属于正常休息日或法定节假日，根据《工资支付暂行规定》及相关劳动法规，劳动者在这些期间享有休息权利，且用人单位应当依法支付工资。此时扣除加班费（或任何形式的工资）均不合法。加班费是劳动者在超出正常工作时间外提供劳动所应得的报酬，与正常休息日的工资支付无直接关联，但工厂不得以休息为由扣减劳动者应得的工资或加班费。

2. 因不可抗力或经营原因安排休息

   • 若工厂因不可抗力因素（如自然灾害、政府要求的停工停产等）或自身经营安排（如生产淡季、设备检修等）导致劳动者休息，根据《工资支付暂行规定》，在一个工资支付周期内，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理，如发放生活费。在此情况下，工厂不得随意扣除加班费，除非劳动者未提供正常劳动且符合发放生活费的条件。但生活费与加班费性质不同，不得混为一谈。

3. 工厂无正当理由安排休息并扣费

   • 若工厂无正当理由强制劳动者休息并扣除加班费，这属于违法行为。工资是劳动者付出劳动后应得的报酬，用人单位不得随意克扣。劳动者有权获得劳动报酬，工厂随意扣费侵犯了劳动者的合法权益。

法律建议与维权途径：

• 若遇到工厂安排休息并扣除加班费的情况，劳动者可先与工厂协商，要求工厂按照法律规定支付工资及加班费。
• 协商无果的，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令工厂改正。
• 劳动者也可以申请劳动仲裁，要求工厂支付克扣的工资、加班费及相应的经济补偿。

可能面临的法律后果：

• 若工厂违反法律规定扣除加班费，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付克扣的工资、加班费及赔偿金等。
• 劳动者也有权通过法律途径维护自身权益，要求工厂承担相应的法律责任。

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