您好，关于您提出的“绩效工资不计入社保基数是否合法”的问题，这主要取决于当地的社会保险法规以及具体政策解释。

以深圳市为例，根据深圳市人大常委会办公厅对市人力资源和社会保障局作出的《关于适用<深圳经济特区社会养老保险条例>第四十八条有关问题的工作答复》意见，该条例第四十八条规定的作为养老保险缴费基数的“工资总额”，应当被理解为用人单位按月发放的劳动报酬。这意味着，非按月发放的津贴、项目奖金、年终奖、季度奖等劳动报酬，并不计入社保的缴费基数。

因此，在深圳市，如果公司将员工的季度绩效工资（即非按月发放的劳动报酬）不列入社保缴交基数，这一做法并不违反相关规定。这一解释也得到了司法实践的支持，例如在广东省深圳市中级人民法院和福田区人民法院的相关判决中，均认可了非按月发放的奖金等不计入社保缴费基数的做法。

当然，不同地区的社会保险法规和政策可能有所不同，因此具体是否合法还需参考当地的法律法规和政策解释。如果您所在的地区有明确规定绩效工资应计入社保基数，而公司未按规定执行，那么公司的做法就可能不合法。

总的来说，要判断绩效工资不计入社保基数是否合法，需要综合考虑当地的法律法规、政策解释以及司法实践。如果您对此仍有疑问，建议咨询当地的社会保险机构或专业律师，以获取更准确和具体的解答。