医院只发基本工资不发绩效是否合法，需根据具体情况判断，以下分情况说明：

1. 若劳动合同或规章制度中有明确约定：

   • 合法情况：如果劳动合同中明确约定了工资构成，包括基本工资和绩效工资，且约定了绩效工资的发放条件和方式（例如，绩效工资根据工作表现、业绩考核等结果发放），同时医院能够证明员工未达到绩效工资的发放条件（如未完成工作任务、考核不合格等），那么医院只发放基本工资而不发放绩效工资是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”若劳动合同中有明确约定，且医院能证明员工未满足绩效发放条件，则医院的行为符合法律规定。

2. 若劳动合同或规章制度中未明确约定，或约定不明：

   • 不合法情况：如果劳动合同中未明确约定工资构成，或者虽然约定了绩效工资但未明确发放条件和方式，且医院无法提供合理理由证明其不发放绩效工资的合法性，那么医院只发放基本工资而不发放绩效工资可能构成违法。此时，员工有权要求医院按照同工同酬的原则，支付其应得的绩效工资。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十六条：“工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。”若医院无法证明其不发放绩效工资的合法性，则可能违反了同工同酬的原则。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 医院经营困难：如果医院因经营困难等原因暂时无法发放绩效工资，但能够与员工协商并达成一致意见，如延期发放、部分发放等，那么这种行为可能不构成违法。但医院需确保与员工的协商过程合法合规，且最终能够履行协商结果。
   • 员工过错：如果员工因个人过错（如严重违反医院规章制度、给医院造成重大损失等）导致医院决定不发放其绩效工资，且医院能够提供充分证据证明员工的过错行为，那么医院的行为可能具有合法性。但这种情况需严格依据医院规章制度和法律法规进行判断。

建议与行动：

• 员工方面：如果员工认为医院的行为违法，可以先与医院进行协商，要求医院按照劳动合同约定或国家规定支付劳动报酬。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 医院方面：医院应确保劳动合同的合法性和有效性，明确工资构成和发放条件。在发放工资时，应严格按照劳动合同约定和国家规定进行，避免出现违法违规行为。

总结：医院只发基本工资不发绩效是否合法，需根据劳动合同约定、医院规章制度以及实际情况进行综合判断。如有疑问或争议，建议及时咨询专业律师或相关劳动部门以获取准确法律意见。