在多个申请执行人中，部分愿意垫付评估费而部分不愿意的情况下，法院通常会根据案件具体情况和法律规定，采取以下措施之一进行处理：
法院指定垫付人：
- 在执行程序中，如果需要对被执行财产进行评估以确定其价值，而申请执行人之间就评估费的垫付问题无法达成一致，法院有权根据案件的具体情况，指定某一申请执行人或多个申请执行人共同垫付评估费。
- 法院在指定垫付人时，会综合考虑各申请执行人的经济状况、申请执行的标的额大小以及案件执行的难易程度等因素，力求做到公平合理。
按比例分摊评估费：
- 如果多个申请执行人均不愿意单独垫付评估费，或者法院认为指定某一申请执行人垫付不公平，法院可能会决定由所有申请执行人按照其申请执行的标的额比例共同分摊评估费。
- 这种方式能够确保评估工作的顺利进行，同时避免了对某一申请执行人造成过大的经济负担。
从执行款中优先支付：
- 在评估工作完成后，如果执行程序顺利推进并最终实现了执行款，法院可能会从执行款中优先支付评估费。
- 这种方式能够确保评估费得到及时支付，同时减轻了申请执行人的经济压力。但需要注意的是，如果执行款不足以支付所有费用，包括评估费在内，法院可能会按照法定顺序进行分配。
考虑其他执行措施：
- 如果申请执行人之间就评估费的垫付问题无法达成一致，且法院认为指定垫付人或按比例分摊均不适用，法院可能会考虑采取其他执行措施，如暂停评估工作、中止执行程序等，直至申请执行人之间就评估费的垫付问题达成一致或法院作出最终决定。
在实际操作中，法院会尽量平衡各申请执行人的利益，确保执行程序的顺利进行。如果申请执行人之间就评估费的垫付问题存在争议，建议及时与法院沟通并寻求法律帮助，以维护自身合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。