当员工自动离职时，其工资的计算是一个需要严格遵循法律规定的过程，以确保员工的合法权益得到保障。以下是对员工自动离职时工资如何计算的详细解答：

一、工资计算的基本原则

1. 实际出勤天数：工资应按照员工实际出勤的天数来计算。这通常涉及将月工资标准除以法定的月计薪天数（一般为21.75天），得出日工资，再乘以实际出勤天数。

2. 劳动合同约定：工资计算还需遵循劳动合同中的约定，包括工资标准、支付方式等。

3. 加班情况：如果员工在离职前存在加班，应按照法律规定支付加班工资。加班工资的计算标准根据加班时间的不同而有所区别，如工作日加班、双休日加班和法定节假日加班的工资倍数不同。

二、具体工资计算方式

1. 正常出勤工资：

   • 计算公式：应发工资 = 月工资标准 ÷ 21.75 × 实际出勤天数。
   • 例如，月工资为5000元，实际出勤15天，则应发工资 = 5000 ÷ 21.75 × 15。

2. 加班工资：

   • 工作日加班：月工资 ÷ 21.75 ÷ 8 × 加班小时数 × 1.5倍。
   • 双休日加班（且不能补休）：月工资 ÷ 21.75 ÷ 8 × 加班小时数 × 2倍。
   • 法定节假日加班：月工资 ÷ 21.75 ÷ 8 × 加班小时数 × 3倍。

3. 奖金、津贴等：

   • 如果员工符合奖金、津贴的发放条件，如全勤奖、岗位津贴等，用人单位应按规定发放。

三、工资支付时间

• 根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
• 工资支付不应以办理离职交接为前提，用人单位应确保在离职时即时结清工资。

四、特殊情况处理

1. 损失赔偿：

   • 如果员工自动离职给用人单位造成经济损失，用人单位可以依法要求员工赔偿。但损失赔偿应与工资结算分开处理，且每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 法律条款依据：

   • 工资计算应严格遵循《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《工资支付暂行规定》等相关法律法规。

五、总结与建议

• 员工自动离职时，其工资的计算应基于实际出勤天数、劳动合同约定的工资标准以及加班情况等因素进行准确核算。
• 用人单位应确保在解除或终止劳动合同时一次付清员工工资，并遵守相关法律法规，保障员工的合法权益。
• 如有任何争议或纠纷，建议双方及时咨询专业律师或相关机构，以维护自身的合法权益。

希望以上解答能对您有所帮助。如有任何进一步的问题或疑虑，请随时咨询。