结论前置：
- 公司无权因工伤对员工进行罚款；
- 公司扣发年终奖金是否合法需结合具体情况判断。
详细分析：
一、公司罚款行为的合法性
根据《工伤保险条例》及《劳动合同法》相关规定：
- 工伤责任原则：员工因工作遭受事故伤害或患职业病，应认定为工伤，享受工伤保险待遇。用人单位不得以任何理由对工伤员工进行罚款，否则构成违法。
- 罚款的禁止性规定：我国《劳动法》《劳动合同法》明确禁止用人单位随意克扣劳动者工资。若公司以“工伤事故责任”为由罚款，需满足以下条件之一：
- 员工存在故意或重大过失；
- 公司规章制度已明确罚款标准且经民主程序制定、公示。
但实践中，工伤事故通常不视为员工个人过错，公司罚款缺乏法律依据。
二、扣发年终奖金的合法性
年终奖属于劳动报酬的一部分，其发放需遵循以下规则：
- 有约定从约定：若劳动合同、公司规章制度或录用通知中明确约定年终奖发放条件（如“全年无事故”“绩效考核达标”等），且员工未满足条件，公司可扣发。
- 无约定时需合理：若未明确约定，公司不得单方扣发。根据《劳动合同法》第30条，用人单位应及时足额支付劳动报酬。工伤员工已提供正常劳动，公司扣发年终奖可能被认定为拖欠工资。
- 例外情形：若公司能证明员工因故意或重大过失导致工伤（如违规操作），且规章制度中明确此类情形可扣发奖金，则可能合法。但需注意：
- 规章制度需经民主程序制定并公示；
- 扣发比例需合理，不得完全剥夺员工权益。
建议行动：
- 核查公司制度：要求公司提供扣发奖金的书面依据（如规章制度条款）；
- 收集证据：保留劳动合同、工资条、工伤认定书等材料；
- 协商或投诉：
- 与公司协商要求补发奖金；
- 向当地劳动监察大队投诉（12333热线）；
- 申请劳动仲裁（需在1年内提出）。
如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细方案。