在职期间申请劳动仲裁时，劳动关系终止时间的确定需结合具体情形判断，核心结论如下：

1. 若劳动合同已到期且未续签
   劳动关系终止时间原则上为合同到期日。但需注意：若用人单位未及时办理终止手续且劳动者继续提供劳动，可能被认定为劳动关系延续，此时终止时间需以实际解除或终止行为发生日为准（如用人单位明确通知不再续签且劳动者停止工作）。

2. 若用人单位单方解除劳动合同
   终止时间为解除通知送达劳动者之日。例如：

   • 用人单位以书面形式通知解除，且劳动者签收或通过合法途径（如邮件、短信）确认收到，则通知送达日为终止日；
     
   • 若用人单位未依法送达解除通知（如未留存送达证据），劳动者可主张劳动关系持续至仲裁或诉讼裁决生效日。

3. 若劳动者主动辞职
   终止时间为辞职通知期满日（如提前30日书面通知的，第30日为终止日；试用期提前3日的，第3日为终止日）。但若用人单位在通知期内提前批准离职，则以实际离职日为准。

4. 若因用人单位违法行为导致劳动者被迫离职
   例如未足额支付劳动报酬、未缴纳社保等，劳动者可依据《劳动合同法》第38条主张即时解除，此时终止时间为劳动者明确通知用人单位解除之日（如发送解除通知书当日）。

5. 特殊情形：停工留薪期、医疗期等
   若劳动者处于法定保护期（如工伤停工留薪期、医疗期），用人单位不得单方终止劳动关系，终止时间需顺延至保护期满。例如医疗期满后，用人单位需提前30日通知或支付代通知金方可终止。

关键提醒：

• 劳动关系终止时间的认定直接影响经济补偿金、工资结算等权益，建议劳动者在仲裁时提交充分证据（如劳动合同、解除通知、考勤记录、工资流水等）以证明终止时间。
  
• 若对终止时间存在争议，可要求仲裁委结合双方行为、行业惯例及公平原则综合判定。
  

如有具体案件细节或证据材料，可进一步向我说明，我会为您详细分析。