在职员工申请劳动仲裁的时间规定主要依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，具体如下：
一般时效：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这意味着，从在职员工知道或应当知道其权益被侵害之日起，他们有一年的时间来申请劳动仲裁。
特殊时效：
- 在某些特定情况下，如劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受上述一年仲裁时效期间的限制。但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。这是为了保护劳动者在劳动关系存续期间可能因各种原因（如害怕失去工作）而不敢或不能及时主张自己的权益。
时效中断与中止：
- 时效中断：在仲裁时效期间内，如果因一方当事人向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断，那么从中断时起，仲裁时效期间将重新计算。
- 时效中止：如果因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
法律建议：
- 及时主张权益：在职员工在发现自己的权益被侵害后，应尽快收集证据并准备申请劳动仲裁，以免错过时效期间。
- 了解特殊规定：对于因拖欠劳动报酬等特定争议，员工应了解并利用好特殊时效规定，确保自己的权益得到充分保护。
- 保留证据：在整个过程中，员工应妥善保留与争议相关的所有证据，包括但不限于劳动合同、工资单、工作记录、沟通记录等，以便在申请仲裁时提供有力支持。
可能后果：
- 如果员工未能在规定的时效期间内申请劳动仲裁，那么他们可能会失去通过法律途径维护自己权益的机会。因此，及时、准确地了解并应用时效规定对于员工来说至关重要。
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