原公司拒开离职证明且虚假申报税务（带薪）的行为，背后可能存在以下原因，但需明确的是，这些行为均涉嫌违法，公司应承担相应法律责任：
1. 逃避法律责任或掩盖违法行为
- 拒开离职证明：根据《劳动合同法》第五十条，用人单位应在解除或终止劳动合同时出具离职证明。拒开证明可能意图掩盖非法解雇、未结清工资或社保等违法行为，避免员工通过离职证明维权。
- 虚假申报税务（带薪）：若公司虚报员工工资为“带薪”（即实际未支付但申报已支付），可能为偷逃企业所得税或个人所得税。例如，通过虚增成本减少应纳税所得额，或帮助员工“避税”以换取其他利益（如低价转让股权）。
2. 管理混乱或内部矛盾
- HR流程失误：部分公司可能因HR部门疏忽或流程不规范，导致未及时开具离职证明。但此情形下，公司通常不会同时存在虚假税务申报行为。
- 内部利益冲突：若员工离职涉及高层矛盾（如举报公司违规），公司可能通过拒开证明、虚假申报等手段报复，试图破坏员工再就业或引发税务调查。
3. 恶意竞争或打击报复
- 行业恶意竞争：若员工离职后加入竞争对手公司，原公司可能通过拒开证明、虚假申报等手段干扰其新工作（如新雇主要求提供原单位离职证明及纳税记录），甚至借税务问题举报员工或新公司。
- 个人恩怨：管理层与员工存在私人矛盾时，可能利用职权实施上述行为，以达到打击报复目的。
4. 财务或税务筹划的非法手段
- 虚构成本：公司可能通过虚假申报员工工资为“带薪”，虚增人力成本以减少企业所得税。例如，实际支付工资10万元，但申报为15万元，多报部分用于冲抵其他收入。
- 转移利润：部分公司通过虚假申报将利润转移至关联企业或个人账户，以逃避分红税或增值税。
法律后果与建议
对公司的法律责任：
- 拒开离职证明：员工可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁要求公司出具证明并赔偿损失（如因未开具证明导致的新工作机会丧失）。
- 虚假税务申报：根据《税收征收管理法》第六十三条，公司可能面临补缴税款、滞纳金及罚款（0.5倍至5倍税款）；情节严重者，直接责任人可能被追究刑事责任（逃税罪）。
对员工的应对建议：
- 收集证据：保留与公司的沟通记录（如邮件、录音）、工资条、社保记录等，证明公司未支付工资或拒开证明。
- 同步维权：
- 向劳动监察大队举报公司拒开离职证明；
- 向税务机关举报公司虚假申报（可通过12366纳税服务热线或电子税务局提交举报材料）；
- 申请劳动仲裁，要求公司支付拖欠工资、经济补偿金及赔偿损失。
若您遇到此类情况，建议立即固定证据并启动法律程序。此类行为不仅损害员工权益，也暴露公司管理严重违法，需通过法律手段维护自身权利。