结论前置：

1. 从法律义务角度讲，老板没有必须打电话沟通的义务。
2. 但从维护良好关系、避免潜在纠纷的角度考虑，老板主动沟通可能是有益的。

详细分析：

一、法律义务角度

在劳动法律关系中，一旦员工提出辞职并完成了相应的离职手续，双方基于劳动合同的权利义务关系即告终止（除涉及竞业限制、保密义务等特殊约定外）。店员误会老板这一事件，并不构成法律上的争议点或需要法律程序解决的纠纷，除非该误会涉及到了对老板名誉的损害或造成了其他法律上的后果。因此，从法律义务的角度来看，老板并没有必须打电话与已辞职的店员进行沟通的义务。

二、维护关系与避免纠纷角度

尽管法律上没有强制要求，但考虑到以下几点，老板主动与店员沟通可能是有益的：

1. 维护良好关系：在职场中，良好的人际关系对于个人和组织的长期发展都是有益的。即使店员已经辞职，保持一种友好和尊重的态度也有助于维护双方的关系，为未来可能的合作或推荐留下良好的印象。

2. 澄清误会：如果店员的误会涉及到了对老板或店铺的负面评价，及时沟通可以澄清事实，避免误会进一步扩大，对店铺的声誉造成不必要的损害。

3. 避免潜在纠纷：在某些情况下，误会可能引发不必要的法律纠纷，如名誉权侵权等。通过主动沟通，可以及时发现并解决问题，避免纠纷的发生。

三、沟通方式与内容建议

如果老板决定与店员进行沟通，以下是一些建议：

1. 选择合适的沟通方式：根据店员的偏好和实际情况，选择电话、邮件或面对面等方式进行沟通。

2. 保持冷静和尊重：在沟通过程中，保持冷静和尊重的态度，避免情绪化的言辞或行为。

3. 明确沟通目的：清晰地表达沟通的目的，即澄清误会、维护关系或解决其他问题。

4. 倾听店员的意见：给予店员充分表达意见的机会，认真倾听并理解其立场和感受。

四、特殊情况考虑

如果店员的误会涉及到了对老板或店铺的严重指控或损害，且店员拒绝沟通或沟通无果，老板可能需要考虑采取法律手段来维护自己的权益。在这种情况下，建议老板咨询专业律师，了解具体的法律程序和应对策略。

综上所述，虽然从法律义务的角度来看，老板没有必须打电话与已辞职的店员进行沟通的义务，但考虑到维护良好关系、避免潜在纠纷等因素，主动沟通可能是有益的。如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。