核心结论：未做满三个月离职，发薪日不在职是否按15天算，不能一概而论，需结合劳动合同约定、公司规章制度以及相关法律法规综合判断。以下分情况详细说明：

1. 劳动合同有明确约定
   若劳动合同中明确约定“未做满三个月离职，发薪日不在职的，工资按实际出勤天数或特定标准（如15天）计算”，则需按合同约定执行。但需注意，该约定不得违反法律法规的强制性规定（如不得低于当地最低工资标准）。若约定合法有效，公司可按约定支付工资；若约定违法（如恶意克扣工资），则该条款无效，公司仍需按实际出勤天数支付工资。

2. 公司规章制度有规定
   若劳动合同未约定，但公司规章制度中明确规定了“未做满三个月离职，发薪日不在职的工资计算方式”，且该制度已通过民主程序制定并公示（或已告知劳动者），则可按制度执行。但同样需确保制度内容合法合规，不得侵犯劳动者合法权益。若制度违法，劳动者有权要求公司按实际出勤天数支付工资。

3. 无约定或制度规定
   若劳动合同和公司规章制度均未对“未做满三个月离职，发薪日不在职的工资计算方式”作出规定，则公司应按劳动者实际出勤天数支付工资。根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。因此，公司不得以“未做满三个月”或“发薪日不在职”为由，擅自扣减工资。

温馨提示：若公司未按上述规则支付工资，劳动者可先与公司协商；协商不成，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。如有其他疑问，欢迎直接向我咨询。