诉讼时效抗辩可以书面提出，且被告可以选择不出庭。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼时效抗辩的提出方式
书面提出：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，被告在答辩期内有权提出诉讼时效抗辩。这种抗辩可以通过书面形式提交给法院，作为对原告诉讼请求的回应。
- 书面提出诉讼时效抗辩具有明确性和可追溯性，有助于法院在审理过程中准确把握被告的抗辩理由。
口头提出（虽非直接相关，但为全面性考虑）：
- 虽然在正式的法律文书中，诉讼时效抗辩通常以书面形式提出，但在庭审过程中，被告或其代理人也可以口头提出抗辩意见。然而，为了确保抗辩的准确性和完整性，书面提出仍是更为推荐的方式。
二、被告不出庭的法律后果
缺席判决的风险：
- 如果被告选择不出庭，法院可能会根据原告提供的证据和陈述进行缺席判决。这意味着被告将失去在庭审中直接陈述和抗辩的机会。
- 然而，即使被告不出庭，其之前提交的书面诉讼时效抗辩仍然有效，法院在审理过程中会予以考虑。
诉讼时效抗辩的独立性：
- 诉讼时效抗辩是被告的一项重要权利，其提出并不依赖于被告是否出庭。只要被告在答辩期内提交了书面诉讼时效抗辩，法院就会在审理过程中对其进行审查。
三、实际操作建议
及时提交书面抗辩：
- 被告应在答辩期内及时提交书面诉讼时效抗辩，以确保其抗辩权利得到有效行使。
- 书面抗辩应明确、具体地阐述诉讼时效抗辩的理由和依据，以便法院在审理过程中能够准确把握。
考虑出庭的必要性：
- 尽管被告可以选择不出庭，但出庭有助于被告更直接地了解庭审情况，及时对原告的陈述和证据进行反驳和抗辩。
- 如果被告对案件结果非常重视，或者认为出庭有助于更好地维护自己的权益，那么出庭可能是一个更明智的选择。
寻求专业法律帮助：
- 在处理涉及诉讼时效抗辩的案件时，被告可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和指导，帮助被告更好地行使自己的权利。